Connect with us

science

Incorporé dans le génome des microbes – les scientifiques ont découvert plus de 30 000 virus « cachés »

Published

on

Incorporé dans le génome des microbes – les scientifiques ont découvert plus de 30 000 virus « cachés »

Les scientifiques ont analysé plusieurs gigaoctets de séquence d’ADN microbien. Crédit : Fabian Oswald

Des milliers de virus mystérieux ont été détectés dans l’ADN d’organismes unicellulaires.

Des chercheurs de l’Université d’Innsbruck, à l’aide d’un groupe de calcul haute performance connu sous le nom de « Leo », ont identifié plus de 30 000 nouveaux virus intégrés dans[{ » attribute= » »>DNA of unicellular organisms. Remarkably, they discovered that up to 10% of microbial DNA can consist of built-in viruses.

Christopher Bellas

Christopher Bellas. Credit: Christopher Bellas

Dr. Christopher Bellas, Marie-Sophie Plakolb, and Prof. Ruben Sommaruga from the Department of Ecology were carrying out an extensive analysis of complex unicellular microbes when they stumbled upon this extraordinary finding. They discovered that these hitherto unknown viruses were encoded directly into the microbe’s genetic structure. This “hidden” viral DNA could potentially enable the creation of fully functional viruses within the host cell.

“We were very surprised by how many viruses we found through this analysis,” says Bellas. “In some cases, up to 10% of a microbe’s DNA turned out to consist of hidden viruses.” These viruses do not appear to harm their hosts. On the contrary, some may even protect them. Many appear to be similar to so-called virophages. These viruses infect and destroy other, harmful viruses that infect their host cell.

The study, financed by the Austrian Science Fund (FWF), was published in the renowned journal Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) and was carried out in collaboration with researchers from the Max Planck Institute for Medical Research and the University of Groningen.

Viruses as protectors

From bacteria to humans, all life forms are continuously infected with viruses. Some are constantly present, but only occasionally trigger symptoms, such as the herpes virus in humans. Others hide even deeper, becoming part of their host’s DNA. This study found that many of the Earth’s abundant single-celled eukaryotic (complex) organisms are packed with viruses. These organisms are found everywhere, and include abundant algae in lakes and oceans, amoebae in soil, as well as human parasites.

“Why so many viruses are found in the genomes of microbes is not yet clear,” says Bellas. “Our strongest hypothesis is that they protect the cell from infection by dangerous viruses.” Many eukaryotic single-celled organisms are infected by “giant viruses”, a group of viruses that can be as large as bacteria. These infections kill the host as they create new copies of the giant virus. However, when a virophage resides in the host cell, it ‘reprograms’ the giant virus to build virophages. As a result, the giant virus can sometimes be fended off and the host cell population is saved from destruction.

Ruben Sommaruga

Ruben Sommaruga. Credit: Laura Sommaruga

The DNA of the newly discovered viruses is similar to virophage DNA. Therefore, it is probable that the host microbes protect themselves from giant viruses through these built-in viruses.

DNA from an alpine lake

The research project was originally based on a new group of viruses that Bellas and Sommaruga discovered in the water of the Gossenköllesee in Tyrol, Austria, in 2021. “Initially, we wanted to find the origin of the new ‘Polinton-like viruses’ with our study,” explains Bellas. “However, we did not know which organisms are usually infected by these viruses. That’s why we conducted a large-scale study to test all microbes whose DNA sequences are known.”

The huge data set that the researchers examined only contains DNA sequences, i.e. a sequence of the letters ATGC from which all genes are encoded. Nevertheless, the data set consists of several hundred gigabytes.

The sequences of viruses, tiny by comparison, could only be found in this large amount of data thanks to state-of-the-art technology. With the high-performance computer cluster “Leo” of the University of Innsbruck, the data set could be analyzed quickly. DNA sequences from microbes were also read using the new Oxford Nanopore technology. With this technology, DNA is passed through tiny pores in a membrane. Each base – A, G, C, or T – interrupts an electric current and thus generates a signal from which the DNA sequence can be read.

In the end, the researchers found much more than the viruses they were looking for. This unexpected discovery will inspire more research to study the roles that these viruses play.

Reference: “Large-scale invasion of unicellular eukaryotic genomes by integrating DNA viruses” by Christopher Bellas, Thomas Hackl, Marie-Sophie Plakolb, Anna Koslová, Matthias G. Fischer and Ruben Sommaruga, 10 April 2023, Proceedings of the National Academy of Sciences.
DOI: 10.1073/pnas.2300465120

The study was funded by the Austrian Science Fund.

READ  Qui sera le premier à piloter le vaisseau spatial Boeing Starliner le mois prochain ?
Continue Reading
Click to comment

Leave a Reply

Votre adresse e-mail ne sera pas publiée. Les champs obligatoires sont indiqués avec *

science

Récupération scientifique sur le télescope spatial Hubble après un problème de rotation

Published

on

Récupération scientifique sur le télescope spatial Hubble après un problème de rotation

Illustration du télescope spatial Hubble au-dessus de la Terre. Crédit image : ESA/Hubble (M. Kornmesser et LL Christensen)

Le 30 avril 2024, NASA Elle a annoncé qu'elle avait regagné l'agence Le télescope spatial Hubble Aux opérations scientifiques le 29 avril. Le vaisseau spatial est à nouveau sain et opérationnel grâce à ses trois gyroscopes. Tous les instruments de Hubble sont en ligne et le vaisseau spatial a repris ses observations scientifiques.

La NASA a commencé à travailler à la reprise des opérations scientifiques après que le télescope spatial Hubble soit entré en mode sans échec le 23 avril en raison d'un problème persistant de gyroscope. Les instruments de Hubble sont restés stables et le télescope était en bonne santé.

Le télescope passait automatiquement en mode sans échec lorsque l'un des trois gyroscopes donnait de fausses lectures. Les gyroscopes mesurent les taux de rotation du télescope et font partie du système qui détermine la direction vers laquelle pointe le télescope. En mode sans échec, les opérations scientifiques sont suspendues et le télescope attend de nouvelles directions depuis la Terre.

Dernier lancement de Hubble au-dessus de la Terre

Le télescope spatial Hubble vu depuis la navette spatiale Atlantis (STS-125) en mai 2009, lors du cinquième et dernier service de l'observatoire en orbite. Crédit : NASA

Ce gyroscope particulier a amené Hubble à passer en mode sans échec en novembre après avoir renvoyé des lectures erronées similaires. L’équipe travaille actuellement à identifier des solutions potentielles. Si nécessaire, le vaisseau spatial peut être reconfiguré Cela fonctionne avec un seul gyroscopeavec l'autre gyroscope restant en réserve.

Le vaisseau spatial disposait de six nouveaux gyroscopes qui ont été installés lors de la cinquième et dernière mission d'entretien de la navette spatiale en 2009. À ce jour, trois de ces gyroscopes sont toujours opérationnels, dont celui qui vient de basculer. Hubble utilise trois gyroscopes pour une efficacité maximale, mais peut continuer à effectuer des observations scientifiques en utilisant un seul gyroscope si nécessaire.

READ  SpaceX lance avec succès le satellite italien d'observation de la Terre Cosmo-SkyMed après des retards

La NASA s'attend à ce que Hubble continue à faire des découvertes révolutionnaires et à travailler avec d'autres observatoires, tels que le télescope spatial James Webb de l'agence, tout au long de cette décennie et peut-être au cours de la suivante.

Lancé en 1990, Hubble observe l'univers depuis plus de trois décennies et a récemment célébré son 34e anniversaire.

Continue Reading

science

Les missions sur Mars se préparent à d'intenses tempêtes solaires sur la planète rouge • Earth.com

Published

on

Les missions sur Mars se préparent à d'intenses tempêtes solaires sur la planète rouge • Earth.com

Alors que le Soleil entre dans une période d’activité maximale connue sous le nom de maximum solaire, les scientifiques se préparent à étudier l’impact des tempêtes solaires sur l’exploration spatiale future, en particulier sur Mars.

Selon Shannon Carey, chercheuse principale à la NASA Vétéran (Martian Atmosphere and Volatile Evolution), cette opportunité rare fournira des informations précieuses sur les effets du rayonnement solaire sur la planète rouge.

Comprendre les tempêtes solaires et leur impact sur Mars

Le maximum solaire, qui se produit environ tous les 11 ans, est une période où le Soleil est particulièrement enclin à provoquer des crises de colère sous la forme d'éruptions solaires et d'éjections de masse coronale. Ces événements libèrent des radiations profondément dans l’espace, et lorsqu’une série d’entre eux éclatent, on parle de tempête solaire.

Alors que le champ magnétique terrestre protège largement notre planète des effets de ces tempêtes, Mars est plus vulnérable en raison de l’absence de champ magnétique global.

Carey, dont les recherches sont gérées par la NASA Centre de vol spatial Goddard À Greenbelt, dans le Maryland, elle a exprimé son désir de voir un événement solaire majeur sur Mars cette année.

« Pour les humains et les biens sur Mars, nous n'avons pas une solide compréhension de l'impact du rayonnement pendant l'activité solaire », a déclaré Carey. « En fait, j'aimerais voir un 'grand événement' sur Mars cette année – un grand événement que nous pourrions étudier pour mieux comprendre le rayonnement solaire avant que les astronautes ne se rendent sur Mars. »

MAVEN et Curiosity forment le duo dynamique de la NASA

Pour étudier l'effet de l'activité solaire sur Mars, NASA Il est basé sur deux engins spatiaux : le vaisseau spatial MAVEN et… Curiosité errante. MAVEN détecte les radiations, les particules solaires et bien plus encore au-dessus de la surface de Mars, tandis qu'un détecteur évalue les radiations à bord du Curiosity (Rad) mesure le rayonnement atteignant la surface de la planète.

READ  « La plus ancienne forêt fossile du monde » découverte dans des falaises de la côte sud de l'Angleterre

Don Hassler, chercheur principal du RAD au Southwest Research Institute de Boulder, Colorado, a expliqué l'importance d'étudier la quantité et l'énergie des particules solaires.

« Vous pourriez avoir un million de particules de faible énergie ou 10 particules de très haute énergie », a déclaré Hassler. « Bien que les instruments MAVEN soient plus sensibles aux instruments à faible énergie, RAD est le seul instrument capable de voir les instruments à haute énergie pouvant traverser l'atmosphère jusqu'à la surface, où se trouveront les astronautes. »

Lorsque MAVEN détecte une grande éruption solaire, l'équipe de l'orbiteur alerte l'équipe Curiosity afin qu'elle puisse surveiller les changements dans les données RAD.

Les deux missions peuvent également compiler une série chronologique mesurant les changements jusqu’à une demi-seconde lorsque les particules atteignent l’atmosphère martienne, interagissent avec elle et finissent par toucher la surface.

Protection des vaisseaux spatiaux et des astronautes

MAVEN dirige également un système d'alerte précoce qui permet aux autres équipes d'engins spatiaux de Mars de savoir quand les niveaux de rayonnement commencent à augmenter.

Cette alerte permet aux missions d'éteindre les appareils susceptibles d'être vulnérables aux éruptions solaires, susceptibles d'interférer avec les communications électroniques et radio.

En plus de contribuer à assurer la sécurité des astronautes et des engins spatiaux, l’étude du maximum solaire pourrait également donner un aperçu de la raison pour laquelle Mars est passée d’un monde chaud et humide, semblable à la Terre, il y a des milliards d’années, à un désert gelé aujourd’hui.

Tempêtes solaires et secret de la perte d'eau sur Mars

Les scientifiques s’intéressent particulièrement à l’étude de la relation possible entre les tempêtes de poussière mondiales et la perte d’eau sur Mars.

READ  Le retour d'un échantillon de Mars par la NASA est incertain malgré la priorité scientifique

Certains chercheurs le croient Pendant les tempêtes solairesLes tempêtes de poussière mondiales peuvent contribuer à projeter de la vapeur d’eau dans l’atmosphère, où elle est éliminée.

Si une tempête de poussière mondiale se produisait en même temps qu’une tempête solaire, ce serait l’occasion de tester cette théorie.

Cependant, les tempêtes de poussière à l’échelle mondiale sont rares et les scientifiques réalisent que les chances que cela se produise pendant le maximum solaire actuel sont minces.

L’avenir de l’exploration de Mars et de la protection contre les tempêtes solaires

Alors que la NASA se prépare pour de futures missions humaines sur Mars, il est essentiel de comprendre les effets du rayonnement solaire sur la planète.

Les données collectées par MAVEN et Curiosity lors de ce maximum solaire aideront les agences spatiales à déterminer le niveau de radioprotection dont les astronautes auront besoin sur la planète rouge.

Avec le Soleil le plus actif et Mars le plus proche de notre étoile, les mois à venir seront une période passionnante pour les scientifiques qui étudient la planète rouge.

Les connaissances acquises grâce à cette rare opportunité pourraient non seulement aider à protéger les futurs astronautes, mais pourraient également faire la lumière sur l’histoire mystérieuse de Mars et de ses eaux autrefois abondantes.

—–

Vous aimez ce que j'ai lu ? Abonnez-vous à notre newsletter pour recevoir des articles intéressants, du contenu exclusif et les dernières mises à jour.

Visitez-nous sur EarthSnap, une application gratuite présentée par Eric Ralls et Earth.com.

—–

Continue Reading

science

Les simulations indiquent que la matière noire existe bel et bien

Published

on

Les simulations indiquent que la matière noire existe bel et bien



Les simulations informatiques réalisées par les astronomes soutiennent l'idée de l'existence de la matière noire, selon les chercheurs.

L'ouvrage aborde un débat fondamental en astrophysique : la matière noire invisible doit-elle exister pour expliquer le fonctionnement de l'univers comme il le fait, ou les physiciens peuvent-ils expliquer le fonctionnement des choses en se basant uniquement sur la matière que nous pouvons observer directement ?

Actuellement, de nombreux physiciens pensent qu’il doit exister quelque chose comme la matière noire pour expliquer le mouvement des étoiles et des galaxies.

« Notre recherche montre comment nous pouvons utiliser des relations réelles observées comme base pour tester deux modèles différents pour décrire l'univers », explique Francisco Mercado, auteur principal et récent diplômé de doctorat de l'Université de Californie, département de physique et d'astronomie d'Irvine, qui est maintenant ici. Chercheur postdoctoral au Pomona College. « Nous avons proposé un test robuste pour distinguer les deux modèles. »

Les tests impliquaient l’exécution de simulations informatiques des deux types de matière – matière ordinaire et matière noire – pour expliquer la présence de caractéristiques intéressantes mesurées dans de vraies galaxies.

L'équipe annonce ses résultats en Avis mensuels de la Royal Astronomical Society.

Les caractéristiques des galaxies découvertes par l'équipe « devraient apparaître dans un univers contenant de la matière noire, mais seraient difficiles à expliquer dans un univers sans elle », explique Mercado. « Nous avons montré que de telles caractéristiques apparaissent dans les observations de nombreuses galaxies réelles. En prenant ces données au pied de la lettre, cela réaffirme la position du modèle de matière noire comme le modèle qui décrit le mieux l'univers dans lequel nous vivons. »

READ  L'arpenteur d'exoplanètes Ariel franchit une étape importante

Ces caractéristiques de l'observation de Mercado décrivent des modèles de mouvements des étoiles et des gaz dans les galaxies qui semblent possibles uniquement dans un univers contenant de la matière noire.

« Les galaxies observées semblent être soumises à une relation étroite entre la matière que nous voyons et la matière noire déduite que nous détectons, à tel point que certains ont suggéré que ce que nous appelons la matière noire est une preuve réelle que notre théorie de la gravité est fausse », explique co-auteur James. Pollock, professeur de physique à l'Université de Californie à Irvine et doyen de l'École des sciences physiques de l'UCLA.

« Ce que nous avons montré, c'est que non seulement la matière noire prédit la relation, mais que pour de nombreuses galaxies, elle peut expliquer ce que nous voyons plus naturellement que la gravité modifiée. Je suis de plus en plus convaincu que la matière noire est le bon modèle. »

Des caractéristiques apparaissent également dans les observations faites par les partisans d’un univers sans matière noire.

« Les observations que nous avons examinées – les mêmes observations dans lesquelles nous avons trouvé ces caractéristiques – ont été faites par des adeptes des théories sans matière noire », explique le co-auteur Jorge Moreno, professeur agrégé de physique et d'astronomie au Pomona College.

« Malgré leur présence évidente, peu d'analyses ont été effectuées sur ces caractéristiques par cette communauté. Il a fallu des gens comme nous, des scientifiques travaillant à la fois avec la matière ordinaire et la matière noire, pour entamer la conversation. »

READ  Le vent solaire frappe la Terre cette semaine: ScienceAlert

Moreno ajoute qu'il s'attend à ce qu'un débat au sein de sa communauté de recherche suive à la suite de l'étude, mais il pourrait y avoir un terrain d'entente, car l'équipe a également constaté que de telles caractéristiques n'apparaissent dans leurs simulations que lorsque la matière noire et la matière ordinaire sont toutes deux présentes. présent. La matière dans l'univers.

« Lorsque les étoiles naissent et meurent, elles explosent en supernovae, qui peuvent former le centre des galaxies, ce qui explique naturellement la présence de ces caractéristiques », explique Moreno. « En termes simples, les caractéristiques que nous avons examinées dans les observations nécessitent l'existence de matière noire et l'incorporation de la physique de la matière ordinaire. »

Maintenant que le modèle de matière noire de l’univers semble être le modèle leader, la prochaine étape, explique Mercado, consiste à voir s’il reste cohérent dans l’univers de la matière noire.

« Il sera intéressant de voir si nous pouvons utiliser cette même relation pour différencier les différents modèles de matière noire », explique Mercado. « Comprendre comment cette relation évolue selon différents modèles de matière noire peut nous aider à limiter les propriétés de la matière noire elle-même. »

Chercheurs supplémentaires de l’Université du Texas à Austin ; Institut de technologie de Californie ; Université de Californie, Davis ; L'Université Northwestern a collaboré aux travaux.

Le financement du travail provient d'un prix MSP-Ascend décerné par la National Science Foundation à Mercado. Mercado et Bullock ont ​​reçu le soutien de la NSF et de la NASA. Moreno reçoit un financement de la Fondation Hirsch.

source: Université de Californie, Irvine

Continue Reading

Trending

Copyright © 2023