Évolution d’une variante alpha pour supprimer le système immunitaire et Omicron a une mutation similaire : une étude

par Alexandra May Jones

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Toronto (Réseau CTV) – De nouvelles recherches sur la façon dont la première variante inquiétante est apparue à propos du nouveau coronavirus ont révélé que la variante alpha développait des mutations qui supprimaient certains aspects du système immunitaire, similaires aux mutations observées dans de nouvelles variantes telles que l’Omicron.

La variante alpha est apparue pour la première fois au Royaume-Uni à l’automne 2020, donnant au monde un indice effrayant sur les variantes du SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19. Bien que les variantes ultérieures, notamment delta et omicron, aient depuis été dépassées, l’étude de la structure et de la fonction de l’alpha aide les scientifiques à mieux comprendre comment les variantes virales évoluent.

Des chercheurs des États-Unis et du Royaume-Uni ont travaillé ensemble pour étudier comment l’alpha attaque le corps humain et ont découvert que les mutations qui lui ont permis de prospérer ne dépassaient que celles centrées sur la protéine de pointe.

Leurs recherches, décrites dans la revue Nature jeudi, ont découvert que la variante alpha augmente la production d’une protéine spécifique qui peut l’aider à supprimer la façon dont les cellules infectées envoient des signaux au système immunitaire.

Pour examiner plus en détail le fonctionnement de la variante alpha, les chercheurs ont examiné des cellules de laboratoire infectées par cette variante pour surveiller les niveaux de protéines et le fonctionnement des cellules.

Ensuite, ils ont comparé les données sur la façon dont les cellules ont répondu à l’infection avec la souche originale de COVID-19. La plus grande différence résidait dans la façon dont la réponse immunitaire innée du corps réagissait ou non. C’est la première ligne de défense du corps, qui essaie d’empêcher l’entrée d’agents pathogènes. Les chercheurs disent qu’Alpha entre dans le cri de la foule qui active normalement ce système.

À l’intérieur des cellules infectées par Alpha se trouvait une abondance de trois protéines virales connues pour aider COVID-19 à échapper à la réponse immunitaire. L’un en particulier, appelé Orf9b, y est parvenu en bloquant une protéine dans nos cellules qui active normalement les gènes qui envoient des signaux pour que notre système immunitaire réagisse.

Ce type de mutation aurait pu favoriser la transmission du variant alpha en supprimant davantage cette réponse immunitaire précoce, ce qui aurait pu permettre au variant de se répliquer plus rapidement, ont déclaré les chercheurs de l’étude.

Ces résultats montrent que la protéine de pointe n’est pas le seul facteur que les chercheurs devraient prendre en compte lors de la conception de traitements pour aider les personnes atteintes de COVID-19.

Étant donné que le SRAS-CoV-2 utilise des protéines de pointe à sa surface pour se lier aux récepteurs des cellules d’une personne, on parle souvent davantage des mutations des protéines de pointe que chez d’autres espèces. Avec une variante delta, on pense que la protéine Spike est plus efficace pour l’aider à mieux s’intégrer dans nos cellules, et tous les vaccins COVID-19 actuels sont ciblés pour que nos cellules produisent des réponses immunitaires contre cette protéine élevée.

« Les mutations à la hausse permettent au virus d’atteindre les cellules plus efficacement », explique Devan Crogan, l’un des auteurs du document de recherche et président du Quantitative Biosciences Institute (QBI) de l’UCSF et du Coronavirus Research Group (QCRG).

Mais qu’en est-il une fois que le virus est entré dans les cellules ? Il peut y avoir d’autres mutations qui lui permettent de se répliquer davantage.

Bien que chaque variante soit différente, beaucoup partagent des mutations similaires, delta et omicron apparaissant comme des cousins ​​​​de la variante alpha. Delta et Omicron ont tous deux des mutations similaires dans les régions étudiées par les chercheurs dans la variante alpha, ce qui signifie qu’ils peuvent avoir des effets similaires sur le système immunitaire.

« Le virus continuera d’évoluer et de s’adapter à l’hôte, et à chaque fois il s’adaptera de mieux en mieux », a déclaré Lorena Zuliani Alvarez, co-auteur et scientifique senior à QBI, dans le communiqué. « C’est pourquoi Omicron a 53 mutations. »

La recherche suggère que l’étude des mutations en dehors de celles autour de la protéine de pointe donnera aux scientifiques une image plus large du virus au fur et à mesure de son évolution, ce qui sera crucial dans la lutte contre les futures variantes.

« L’étude des variantes préoccupantes nous donne un aperçu de la façon dont le SRAS-CoV-2 pourrait évoluer », a déclaré Mehdi Bouhdou, chercheur postdoctoral et co-auteur, dans le communiqué. « Maintenant, nous avons une idée des protéines qui changent fréquemment et des conséquences biologiques de ces mutations. Je pense que cela nous aide à nous préparer à ce qui pourrait arriver ensuite. « 

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Sonia Bozicsonga