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Le télescope spatial romain Nancy Grace peut enfin nous dire si les trous noirs primordiaux existent ou non
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Une image basée sur une simulation sur ordinateur de l’environnement cosmique dans lequel le gaz primordial s’effondre directement dans un trou noir. Crédit : Aaron Smith/TACC/UTA-Austin
Lorsque l’univers a vu le jour avec le Big Bang, toute sa matière était compressée dans une petite zone. Les cosmologues émettent l’hypothèse que dans certaines régions, la matière subatomique aurait pu être si compacte qu’elle s’est effondrée en trous noirs primordiaux. Si de tels trous noirs primordiaux existent, ils sont de petite taille et pourraient se cacher parmi les habitants de planètes flottantes.
Les trous noirs sont les éléments les plus déroutants de la nature. La théorie de la relativité d’Einstein prédisait leur existence, mais il n’était pas d’accord avec la possibilité que des trous noirs se forment réellement. Pendant que d’autres scientifiques travaillaient sur les équations, ils ont finalement montré que les trous noirs pouvaient exister.
Maintenant, nous savons que c’est le cas, et nous savons qu’il est si dense qu’il déforme l’espace-temps et attire tout vers lui. Même la lumière ne peut pas s’échapper.
Les chercheurs tentent de découvrir l’arbre généalogique des trous noirs. Ils savent que certaines étoiles massives s’effondreront sur elles-mêmes vers la fin de leur vie et formeront des trous noirs de masse stellaire. Ils savent que des trous noirs supermassifs (SMBH) existent au cœur de grandes galaxies comme la Voie lactée. Il existe également de plus en plus de preuves de l’existence de trous noirs de masse intermédiaire (IMBH), situés entre les trous noirs de masse stellaire plus petits et les trous noirs massifs de petite masse stellaire (SMBH).
Mais qu’en est-il des trous noirs primordiaux (PBH) ? S’ils existent, ils se sont formés bien avant que la première étoile ne prenne vie. Selon la théorie, ils peuvent être de n’importe quelle taille et jouer un rôle dans la formation des galaxies. Dans la lutte pour comprendre comment les trous noirs deviennent si massifs, les trous noirs massifs pourraient occuper une importante niche vide. Il existe également des indications alléchantes selon lesquelles, s’ils existent, ils pourraient être des composants de la matière noire.
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Ce graphique montre les masses relatives des objets cosmiques ultra-denses, depuis les naines blanches jusqu’aux trous noirs supermassifs que l’on trouve au cœur de la plupart des galaxies. Les trous noirs primordiaux, s’ils existent, se situent entre les étoiles à neutrons et les trous noirs stellaires. Source de l’image : NASA/JPL-Caltech
De nouvelles recherches montrent comment le télescope spatial romain Nancy Grace de la NASA peut détecter les PBH. Ils pourraient se cacher parmi un mystérieux groupe d’objets de faible masse. Ces objets pourraient être des planètes flottantes (FFP), également appelées planètes voyou, ou des PBH, et un prochain télescope spatial pourrait avoir la capacité de les trouver.
le papier, « Des mondes voyous rencontrent le côté obscur : détection des trous noirs primordiaux de masse terrestre à l’aide du télescope spatial romain Nancy Grace,« Il a été publié sur un serveur de préimpression arXiv. L’auteur principal est William DeRocco du Département de physique de l’Université de Californie à Santa Cruz.
Le télescope spatial romain Nancy Grace sera un puissant télescope infrarouge lors de son lancement dans quelques années. Il a quelques points à retenir en astrophysique sur sa liste de surveillance, comme la mesure de l’énergie noire, de la relativité et de la courbure de l’espace-temps. Il recherchera également des objets de faible masse comme Mars qui ne sont associés à aucune étoile. Ce faisant, cela pourrait faire la lumière sur les trous noirs primordiaux.
Pour rechercher ces objets de faible masse et déterminer s’il s’agit de FFP ou de PBH, le télescope spatial roumain a besoin d’aide. Vous profiterez d’une lentille gravitationnelle précise pour rechercher dans le ciel ces objets insaisissables. Ils peuvent avoir n’importe quelle taille, de la taille d’une seule particule subatomique à la taille d’une petite planète.
« La microlentille gravitationnelle est l’une des techniques d’observation les plus puissantes pour observer des objets astrophysiques non lumineux », écrivent les auteurs dans leur article. « Les observations actuelles par microlentilles fournissent des preuves alléchantes de l’existence d’un groupe d’objets de faible masse dont l’origine est inconnue. »
La question est : ces objets déroutants sont-ils des planètes voyou ? Ou s’agit-il de PBH ?
Le problème lorsqu’on essaie d’observer ces objets est qu’ils ne peuvent pas être suffisamment résolus individuellement. Au lieu de cela, ils doivent être détectés statistiquement, ce qui signifie que nous devons mener une vaste enquête à leur sujet.
« Cependant, la nature de ces objets ne peut pas être résolue événement par événement, car la courbe de lumière induite dégénère pour des objets lenticulaires de masse identique. Il faut plutôt comparer statistiquement les distributions des événements de lentille pour déterminer la nature de l’objet lenticulaire. population », écrivent les auteurs.
Le télescope spatial romain aura fort à faire après son lancement prévu en 2027. L’un de ses principaux programmes d’observation cible directement ces objets astrophysiques de faible masse. C’est ce qu’on appelle l’enquête dans le domaine temporel du Galactic Bulge.
Cette étude est basée sur la densité stellaire dans le renflement galactique. Il existe une forte densité de lentilles et de sources stellaires vers le renflement, et le télescope romain scannera à plusieurs reprises ces régions denses avec son instrument à grand champ (WFI).
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Le ciel étoilé sur cette image prise par la NASA et le télescope spatial Hubble de l’Agence spatiale européenne se situe vers le centre de la galaxie. La lumière des étoiles est surveillée pour voir si un changement dans leur luminosité apparente est causé par un objet au premier plan dérivant devant elles. La distorsion de l’espace par l’intrus provoquerait un éclaircissement momentané de l’apparence de l’étoile d’arrière-plan, un effet appelé lentille gravitationnelle. Parce qu’un trou noir n’émet ni ne reflète la lumière, il ne peut pas être observé directement. Mais leur empreinte unique sur la structure de l’espace peut être mesurée grâce à ce que l’on appelle les événements de microlentille. Bien qu’environ 100 millions de trous noirs isolés parcourent notre galaxie, trouver la signature indubitable de l’un d’entre eux revient à chercher une aiguille dans une botte de foin pour les astronomes de Hubble. Mais le télescope spatial roumain peut en trouver des centaines. Source de l’image : Hubble/CSA/ESA/NASA/STScI
L’équipe de recherche à l’origine du nouvel article affirme que l’enquête a le potentiel de changer notre compréhension de ces objets de faible masse. « En résumé, nos résultats montrent que même dans des hypothèses prudentes concernant le seuil de détection romain et le contexte des FFP, une étude à l’échelle temporelle du renflement galactique sera très sensible à la détection d’une population de PBH dans de nouvelles régions de l’espace des paramètres. .»
« Roman est sur le point non seulement de faire les premières mesures précises de la distribution globale du FFP, mais peut-être également de révéler le sous-ensemble de PBH qu’il contient », ont conclu les chercheurs.
Les deux questions marquantes de la science spatiale moderne concernent l’énergie noire et la matière noire. L’énergie noire est le nom donné à la force qui entraîne l’expansion de l’univers. La matière noire est le nom donné à la masse invisible qui donne sa forme à l’univers et organise ses structures à grande échelle telles que les galaxies et les amas de galaxies. Mais nous ne savons toujours pas ce qu’est la matière noire.
Les trous noirs primordiaux sont l’un des principaux candidats à la matière noire. Si les PBH constituent la totalité ou une partie significative de la matière noire de l’univers, cela expliquerait la structure à grande échelle de l’univers. Ils peuvent également expliquer certains phénomènes de lentille gravitationnelle qui ne peuvent être expliqués par la matière ordinaire. La preuve que les PBH sont de la matière noire n’est en aucun cas concluante, mais certains scientifiques affirment qu’ils constituent tout ou partie de la matière noire de l’univers.
« L’enquête sur le domaine temporel du Renflement Galactique Romain devrait détecter des centaines d’événements de microlentilles de faible masse, permettant ainsi une caractérisation statistique robuste de cette population », expliquent les auteurs. Grâce à ces données d’enquête disponibles, les scientifiques pourraient être prêts à faire de réels progrès sur la matière noire et à commencer à résoudre les mystères les plus profonds de l’univers.
Mais il faudra attendre quelques années.
Plus d’information:
William DiRocco et al., Rogue Worlds Meet the Dark Side: Détection des trous noirs primordiaux de masse terrestre à l’aide du télescope spatial romain Nancy Grace, arXiv (2023). DOI : 10.48550/arxiv.2311.00751
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Une nouvelle technique pour analyser les interactions ARN-ARN dans les cellules microbiennes vivantes
iRIL-seq capture fidèlement les interactions cibles ARNs. crédit: Communications naturelles (2023). est ce que je: 10.1038/s41467-023-43632-1
dans une étude publié dans Communications naturellesle groupe du professeur Zhao Yanjie de l’Institut de l’immunité et des infections de Shanghai de l’Académie chinoise des sciences a rapporté une nouvelle technologie iRIL-seq, qui identifie les interactions moléculaires ARN-ARN dans les cellules microbiennes vivantes.
Grâce à iRIL-seq, les chercheurs ont pour la première fois cartographié les réseaux d’interaction ARN-ARN de Salmonella enterica à différents stades de développement, découvrant ainsi plusieurs nouveaux ARN non codants et d’importants centres de régulation de l’ARNm.
L’interaction directe ARN-ARN est le principal mécanisme par lequel les ARN non codants exercent leurs fonctions. Dans les cellules procaryotes, les petits ARN non codants reconnaissent les ARNm cibles via des interactions d’appariement de bases très courtes et incomplètes, difficiles à prédire et à quantifier.
Les ARN bactériens non codants ont d’importantes fonctions régulatrices, contrôlant l’expression de nombreux gènes cibles au niveau post-transcriptionnel et jouant un rôle essentiel dans de nombreux processus biologiques, tels que l’infection bactérienne, la résistance aux antibiotiques, le métabolisme central, la réponse au stress et la détection du quorum. . , et la formation de biofilms.
L’analyse du réseau d’interactions ARN-ARN revêt une grande importance pour l’étude de la physiologie microbienne et des fonctions des ARN non codants. Cependant, les techniques actuelles de profilage des interactions ARN-ARN sont complexes, nécessitant des cellules fixes et de nombreuses étapes in vitro telles que la digestion, la réparation et l’épissage de l’ARN, ce qui entraîne des interactions d’ARN insuffisantes avec une faible spécificité et précision.
Dans cette étude, les chercheurs ont développé une nouvelle approche de ligature de proximité d’ARN in vivo, iRIL-seq (interaction intercellulaire d’ARN par ligature et séquençage).
Les chercheurs ont d’abord stimulé l’expression de l’enzyme ARN T4 dans des cellules microbiennes vivantes, entraînant une liaison de proximité entre les molécules d’ARN en interaction in vivo. Ils ont ensuite enrichi de petits ARN non codants et de leurs transcrits en interaction par immunoprécipitation du principal petit chaperon d’ARN Hfq.
Ils ont également déterminé l’identité et les séquences des molécules d’ARN en interaction à l’aide du séquençage d’ARN à haut débit. Le processus expérimental principal peut être achevé en une journée, grâce à une réticulation in vivo rapide et à un flux de travail simplifié.
Cette nouvelle technologie élucide non seulement l’atlas du réseau d’interactions microbiennes ARN-ARN, mais identifie également les interactions d’appariement de bases ARN-ARN à une résolution d’un seul nucléotide. iRIL-seq est une technique simple, rapide, précise et universelle pour analyser les interactions ARN-ARN dans les micro-organismes, et propose une nouvelle façon d’étudier les interactions ARN-ARN dans les cellules eucaryotes.
En outre, les chercheurs ont cartographié pour la première fois les interactions dynamiques ARN-ARN du pathogène bactérien Salmonella enterica à plusieurs stades de développement, identifié plus de 2 000 interactions ARN-ARN et découvert plusieurs centres de régulation clés de l’ARNm. Il a été démontré à ce jour que le plus grand centre de régulation de l’ARNm chez les bactéries est l’ARNm codant pour la porine de la membrane externe OmpD, qui est régulée par au moins 12 petits ARN non codants.
La caractérisation expérimentale de ces petits ARN a conduit à l’identification d’un nouveau petit ARN FadZ clivé de l’ARNm 3’UTR par la ribonucléase. L’expression de l’ARNm parental FadZ et fadBA était régulée par les facteurs de transcription en amont FadR et CRP et par la signalisation des acides gras à longue chaîne.
Dans des conditions d’acides gras à longue chaîne, l’ARNs FadZ et le gène cible ompD ont été activés par le facteur de transcription CRP, formant ensemble une boucle de réaction incohérente de type I (I1-FFL). Les résultats ont révélé le mécanisme de régulation post-transcriptionnel des bactéries en réponse au métabolisme des acides gras à longue chaîne chez les hôtes.
Plus d’information:
Fang Liu et al., Le profilage des interactions d’ARN in vivo révèle de petits ARN traités par 3’UTR ciblant un centre de régulation central, Communications naturelles (2023). est ce que je: 10.1038/s41467-023-43632-1
la citation: Une nouvelle technique d’analyse des interactions ARN-ARN dans les cellules microbiennes vivantes (11 décembre 2023) Récupéré le 11 décembre 2023 sur https://phys.org/news/2023-12-technique-rna-rna-interactions-microbienne- cellules . langage de programmation
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10 faits amusants alors que la comète de Halley fait un retour en force
Le 9 décembre 2023, La comète de Halley Il a atteint son apogée et a atteint sa plus grande distance.
Cette image de 1910 de la comète de Halley représente la meilleure vue vue par l’œil humain depuis le développement de la photographie appliquée à l’astronomie. Bien que les comètes soient généralement visibles près du périhélie, ou à l’approche la plus proche du Soleil, elles peuvent être des milliards de fois plus faibles près de l’aphélie, lorsqu’elles sont les plus éloignées.
Ces 10 faits fascinants célèbrent son retour imminent.
Cette vue simulée du ciel montre le ciel de Londres, en Angleterre, au printemps 1066 : lorsque la comète de Halley est revenue. Bien que cet événement ait été enregistré en de nombreux endroits, l’identifier avec le retour de la comète de Halley nécessiterait plusieurs centaines d’années.
1.) Le premier enregistrement remonte à 240 avant JC
Cette ancienne tablette a plus de 2 000 ans et enregistre l’événement de la comète de Halley comme suit : « Au cours de la septième année du règne de l’empereur Qin Shi Huang, empereur des Royaumes combattants, l’étoile à balai est apparue pour la première fois à l’est, et puis apparut dans le nord. «
Repéré en Chineles archives décrivent une « étoile à balai ».
Cette tablette babylonienne enregistre l’apparition de la comète de Halley datant de fin septembre 164 av. Il existe des preuves que la comète de Halley remonte à la préhistoire, mais celle-ci et les enregistrements chinois d’une orbite précédente sont les premiers enregistrements fiables et vérifiables de la comète de Halley vue de la Terre.
2.) L’interrogation de Newton par Halley a conduit aux Principia.
Il n’y aura peut-être pas d’autre Einstein ni d’autre Newton, mais nous pouvons tous apprendre à utiliser leurs équations dans de bonnes conditions physiques. Nous pouvons devenir excellents en physique de la même manière qu’eux : en résolvant des problèmes de manière quantitative.
Newton a dit avec désinvolture à Halley que la loi de la force centrale ~1/r² créerait des orbites elliptiques, Eh bien prouve le.
Les orbites des planètes du système solaire interne ne sont pas parfaitement circulaires, mais elliptiques, comme le sont les orbites de tous les objets liés au Soleil par gravité. Les planètes se déplacent plus rapidement au périhélie (le plus proche du Soleil) qu’à l’aphélie (le plus éloigné du Soleil), conservant leur moment cinétique et obéissant aux lois du mouvement de Kepler, que Newton a fondées sur une base mathématique plus solide et plus généralisée.
3.) Halley a identifié 3 cas de retour antérieurs.
Ce diagramme montre l’orbite de la comète de Halley, en négligeant les effets gravitationnels turbulents des planètes. La comète de Halley passe la plupart de son temps près de l’aphélie, près de l’orbite de Neptune et au-delà, mais elle plonge dans le système solaire interne une fois tous les 74 à 79 ans.
Elle annonce l’arrivée de la comète précédente en 1531, 1607 et 1682 Les prédictions de Halley pour 1705.
La publication originale d’Edmund Halley dans laquelle il a identifié pour la première fois des comètes enregistrées trois fois en 1531, 1607 et 1682 comme le même corps : la comète de Halley, avec un retour attendu en 1758.
4.) Son orbite est variable.
Dans la théorie de la gravitation de Newton, les orbites forment une ellipse parfaite lorsqu’elles se produisent autour de grandes masses uniques. Cependant, en relativité générale, il existe un effet supplémentaire de précession dû à la courbure de l’espace-temps et au fait que les planètes se déplacent par rapport au Soleil, ce qui provoque un déplacement de l’orbite dans le temps, d’une manière qui peut parfois être mesurable. Mercure présente l’effet le plus important au sein de notre système solaire, se déplaçant à un rythme supplémentaire de 43 pouces (où 1 pouce équivaut à 1/3600 de degré) par siècle en raison de cet effet supplémentaire. Pendant ce temps, toutes les comètes qui traversent le système solaire sont affectées par la gravité des planètes qui les composent, ce qui perturbe souvent leurs périodes et leurs trajectoires orbitales.
D’autres planètes, notamment Jupiter, perturbent les orbites des comètes. La périodicité de Halley varie de 74 à 79 ans.
L’animation représente une cartographie des positions des objets géocroiseurs (NEO) connus à des moments précis au cours des 20 dernières années, se terminant par une carte de tous les astéroïdes connus en janvier 2018. Bien que Jupiter absorbe de nombreux astéroïdes et comètes, il peut les absorber. Les rediriger également, ce qui pourrait mettre davantage en danger les terres.
5.) Haley n’a jamais remarqué son retour.
Alors que de nombreuses comètes magnifiques ornent le ciel avec régularité et irrégularité, la plus grande comète du vivant de Halley, en 1680, n’avait aucun lien avec la comète qui porte son nom. Halley n’a jamais vu sa comète revenir, mais elle ressemblait peut-être à la comète 2020 NEOWISE, présentée ici.
Halley calcula un retour en 1758, mais mourut en 1742.
Peint par Isaac Hood vers 1720, ce portrait à l’effigie d’Edmund Halley est considéré comme l’un des plus beaux portraits de l’astronome des XVIIe et XVIIIe siècles.
6.) Son retour conduit au catalogue Messier.
Cette image d’une plaque d’astronomie archéologique du sentier Peñasco Blanco montre un croissant de Lune, une étoile à 10 branches identifiée à une supernova crabienne en 1054, et, en bas, le symbole d’un cercle concentrique avec une extension en forme de flamme : Halley’s On pense que la comète réapparaîtra en 1054. 1066.
En 1758, alors qu’il cherchait une comète, une nébuleuse du ciel profond confondit Charles Messier. Son catalogue a évité toute confusion future.
Grâce à un télescope de qualité du XVIIIe siècle, les comètes, nébuleuses et autres objets étendus ne peuvent pas être facilement distingués les uns des autres. Cela rend très difficile la recherche aveugle d’une comète lente, et la recherche de la comète de Halley en 1758, associée à la redécouverte fortuite de la nébuleuse du Crabe, a incité Charles Messier à développer son célèbre catalogue.
7.) Leur vitesse orbitale varie considérablement.
Avant de comprendre comment fonctionne la loi de la gravité, nous avons pu prouver que tout corps en orbite autour d’un autre corps obéit à la deuxième loi de Kepler : il trace des surfaces égales dans des intervalles de temps égaux, ce qui indique qu’il doit se déplacer plus lentement lorsqu’il est plus éloigné et plus vite quand il est plus proche. . Pour les orbites hautement elliptiques, comme celles des comètes, la vitesse près du périhélie est énorme, tandis que la vitesse près de l’apogée est relativement faible.
au périhélie, Jusqu’à ~ 55 km/s. A l’apogée, la vitesse est inférieure à 1 km/s.
Vu à son apogée (fin 2023-début 2024), la comète de Halley trace une trajectoire très elliptique. À son point le plus proche du Soleil, il passe à l’intérieur de l’orbite de Vénus et juste à l’extérieur de l’orbite de Mercure, tandis qu’à l’aphélie, sa distance la plus éloignée, il est plus comparable aux distances plutoniques.
8.) Ses débris créent des pluies de météores.
La comète 67P/Churyumov-Gerasimenko a été photographiée à plusieurs reprises par la mission Rosetta de l’Agence spatiale européenne, observant sa forme irrégulière, sa surface volatile et dégazante, ainsi que son activité comète. Lorsque de petits fragments de la comète se détachent et s’étirent le long de la trajectoire orbitale du corps parent, ils créent un flux de débris qui déclenchera une pluie de météores partout où il croisera la trajectoire orbitale de la planète.
Non, je peux Amniotes ETA Et octobre Orionides Elle provient de la comète de Halley.
Une vue de nombreuses météorites frappant la Terre sur une longue période, montrées en même temps, depuis la Terre (à gauche) et depuis l’espace (à droite). Si la trajectoire de la comète croise deux fois l’orbite terrestre, sa coulée de débris pourrait créer jusqu’à deux pluies de météores par an.
9.) Ce n’est pas le type de comète le plus courant.
Chaque année, la Terre traverse le flux de débris de la comète Swift-Tuttle, créant un phénomène optique connu sous le nom de pluie de météores des Perséides. La comète Swift-Tuttle reste l’objet le plus dangereux connu de l’humanité : c’est une comète de type Halley, et il lui faut 133 (entre 20 et 200) ans pour boucler son orbite.
116 seulement Type Halley Comètes connues, contre 656 Comètes de la famille Jupiter.
Cette carte montre le flux de débris de la comète Encke, une comète à courte période en orbite autour du Soleil qui est à l’origine de la pluie de météores Thorid. La zone blanche indique l’endroit où le flux de débris est le plus dense et correspond au noyau de la comète, mais les débris se sont étendus sur toute l’orbite de la comète. Les comètes avec des périodes inférieures à 20 ans sont beaucoup plus nombreuses que les comètes de type Halley, qui ont des périodes comprises entre 20 et 200 ans.
10.) Son noyau pourrait bientôt se diviser.
La dernière fois que la comète de Halley a visité le système solaire interne, c’était en 1986, lorsque la sonde Gioto de l’Agence spatiale européenne est passée par là et a capturé cette image à seulement 2 000 kilomètres de distance. Le Soleil, à gauche, chauffe le noyau de la comète, libérant des gaz et de la poussière.
ce Boule de neige à faible densité, tas de gravats Il est Perte de masse rapideIl pourrait bientôt se désintégrer.
Lorsqu’ils tournent autour du Soleil, les comètes et les astéroïdes se brisent généralement au fil du temps, les débris entre les morceaux se dilatant le long de la trajectoire de l’orbite pour former des flux de débris. Ces flux provoquent des pluies de météores lorsque la Terre traverse ce flux de débris. Cette image prise par Spitzer le long de la trajectoire d’une comète montre de petits fragments libérant des gaz, mais elle montre également le principal flux de débris qui donne naissance aux pluies de météores qui se produisent dans notre système solaire.
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Technologie Tricorder : PicoRuler : règles moléculaires pour la microscopie haute résolution
PicoRuler : les règles moléculaires basées sur des protéines permettent de tester la résolution optique des méthodes de microscopie à super-résolution de pointe sur des biomolécules dans la gamme inférieure à 10 nm dans des conditions réalistes. (Photo : Gerti Bilyeu / Université de Würzburg, création DALL·E 3)
Note de l’éditeur: Vous et/ou vos assistants robotiques explorez un nouveau monde où la vie existe. Vous essayez de comprendre la génomique de base, la structure cellulaire et d’autres aspects de sa structure de base. Vous êtes très loin de chez vous et avez besoin d’informations à envoyer à votre domicile mais aussi pour orienter vos sorties de recherche et vos études en laboratoire sur place. Avoir un capteur 3D/portable capable de collecter de telles informations et de les transmettre à votre base d’origine pour une imagerie super-résolution pourrait être un excellent outil. Comment allons-nous équiper les explorateurs humains et robotiques de systèmes d’imagerie pour les missions d’équipe à distance ?
Les dernières méthodes de microscopie à super-résolution atteignent désormais une résolution optique de l’ordre de quelques nanomètres. Cela correspond à la résolution dans la gamme de tailles des molécules cellulaires. Cependant, il n’a pas encore été possible de vérifier la précision obtenue sur des éléments constitutifs cellulaires tels que des complexes multiprotéiques – car il n’existait pas de systèmes de référence biomoléculaires pouvant être marqués avec des colorants à des endroits précis à une distance de quelques nanomètres.
Une équipe dirigée par le Dr Gerti Bilyeu et le professeur Markus Sauer du Centre Rudolf Virchow – le Centre de bioimagerie intégrative et translationnelle de l’Université Julius Maximilians (JMU) de Würzburg en Bavière, en Allemagne, a marqué un tournant. Dans la revue Advanced Materials, ils présentent de nouvelles règles moléculaires biocompatibles, les PicoRulers (règles optiques pour l’étalonnage d’imagerie à base de protéines).
En utilisant l’expansion du code génétique et la chimie des clics, l’équipe a réussi à construire ces règles moléculaires personnalisées. Ils peuvent être utilisés comme structures de référence biomoléculaires précises en microscopie à fluorescence.
Architecture PicoRuler basée sur PCNA pour la microscopie à super-résolution inférieure à 10 nm. A) Représentation de la conception de la règle PCNA, montrant les positions de trois fluorophores identiques à des intervalles de 6 nm. Ceci a été réalisé grâce à l’épitaxie bioorthogonale de ncAA, qui ont été spécifiquement introduits sur le site du PCNA par le GCE. Comme échantillon de référence, nous avons utilisé du PCNA marqué avec DOL ≈0,4. B) SDS-PAGE montrant la pureté du WT PCNA après chaque étape de purification. L : échelle protéique, His : après chromatographie d’affinité au nickel, Strep-Trap : après chromatographie d’affinité Strep-tag et SEC : après chromatographie d’exclusion de taille. La bande du monomère PCNA est marquée d’un triangle rouge. C) PCNA-6 (S186Norb) imagé par TEM sous coloration négative avec de l’acétate d’uranyle. D) Chromatogramme SEC de PCNA-6 (S186Norb) après marquage avec H-Tet-Cy5, confirmant la conjugaison réussie des fluorophores à la protéine PCNA. La fraction contenant le PicoRuler étiqueté est affichée en bleu. Barre d’échelle 5 nm (c) – Matériaux avancés
Un chef-d’œuvre technologique : la précision au niveau moléculaire
Les PicoRulers sont basés sur la protéine en trois parties PCNA (antigène nucléaire de cellules en prolifération), qui joue un rôle clé dans la réplication et la réparation de l’ADN. En insérant soigneusement des acides aminés non naturels dans des emplacements précisément définis, cette protéine a été modifiée de telle manière qu’elle peut cliquer spécifiquement sur des colorants fluorescents ou d’autres molécules avec une erreur de liaison minimale.
Cela permet aux chercheurs de tester l’exactitude des dernières méthodes de microscopie à super-résolution avec une résolution sans précédent sur une biomolécule cellulaire précisément définie.
Markus Sauer s’enthousiasme : « La capacité d’analyser des structures biologiques réelles à un niveau inférieur à 10 nm représente une nouvelle ère dans l’imagerie biologique. Par rapport aux macromolécules synthétiques utilisées précédemment, nos PicoRulers ne sont pas seulement biocompatibles. Ils offrent également une précision inégalée pour tester la précision sous conditions réalistes.
Ouvrir la porte à l’étude de processus complexes dans les cellules
L’application de cette technologie s’étend au-delà des frontières traditionnelles de la microscopie. «Nos PicoRulers ne sont pas seulement un outil permettant d’effectuer des mesures plus précises, mais elles ouvrent également la porte à une étude plus approfondie et plus détaillée des processus complexes qui se produisent à l’intérieur de nos cellules», explique Gertie Bilyeu.
Évaluation photophysique des PicoRulers basés sur PCNA et de l’origami ADN. a, b) Images dSTORM sélectionnées de PicoRulers triplement marqués (DOL ≈ 3,0) et (b) d’origami d’ADN (DOL ≈ 3,0) avec des distances interfluorophores de 6 nm, ainsi que leurs échantillons de référence à marquage unique (réf). Alors que chaque origami d’ADN contient un seul fluorophore, l’échantillon de référence PCNA affiche un DOL ≈0,4 et contient donc également des molécules PCNA non marquées et doublement marquées (taille de pixel 2 nm). Barres d’échelle, 10 nm. c) Occurrence relative des durées de vie OFF, nombre d’états (événements) détectés à partir de PicoRulers individuels dans les expériences dSTORM et nombre d’événements (localisations) détectés par image en fonction du temps (analyse d’empreintes digitales). d) Images FLIM de PicoRulers marqués H-Tet-Cy5 (la référence étiquetée individuellement est affichée en gris et un PicoRuler mesuré par triple-clic est affiché dans une boîte magenta) par imagerie confocale TCSPC dans un tampon de photo-commutation à une intensité d’irradiation de ≈ 2,5 kW cm−2. Pour minimiser le photoblanchiment du fluorophore, les images FLIM ont été enregistrées avec un temps d’intégration de 25 µs pour chaque pixel. Aucun seuil de gravité n’a été appliqué. Barres d’échelle, 2 μm. E) Désintégrations moyennes de fluorescence des PCNA PicoRulers étiquetés avec un (gris) ou trois (violets) fluorophores Cy5. f) Rapports Nc/Nl,av déterminés pour les molécules PCNA de référence à marquage unique et les PicoRulers à triple marquage dans des expériences de résistance à la collecte de photons (n = 13) – Matériaux avancés.
Fort potentiel pour de futures applications
Le développement ultérieur des PicoRulers pourrait modifier à long terme l’imagerie biologique et médicale avec une résolution moléculaire. Pour la première fois, il est devenu possible de valider et d’améliorer le potentiel de résolution de nouvelles méthodes de microscopie à super-résolution sur des échantillons biologiques. Cela en fait un outil précieux pour élucider l’organisation moléculaire et l’interaction des biomolécules dans les cellules à l’avenir.
PCNA en tant que nanoéchelle à base de protéines pour l’imagerie par fluorescence inférieure à 10 nmMatériaux avancés (accès libre)
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