Une étude montre que les changements du microbiote fécal chez les poulains se stabilisent après quelques mois

Des scientifiques australiens ont tracé un graphique des augmentations de l’abondance, de la diversité et de la richesse globales des micro-organismes dans les excréments des poulains au cours des premiers mois de la vie.

Écrivant dans le journal, Grace O’Reilly et ses collègues chercheurs écrivent Frontières en biologie – EliteLes poulains mentionnés subissent une croissance et un développement significatifs de la naissance jusqu’au sevrage. En effet, les poulains se développent de 10% de leur poids adulte à la naissance à 50% au sevrage.

La demande énergétique pour gérer cette croissance précoce implique la transition de l’alimentation du lait au fourrage, soutenue par la colonisation microbienne du tube digestif.

Les relations bénéfiques entre les assemblages bactériens, primordiaux et fongiques augmentent la digestibilité du fourrage de l’intestin postérieur, produisant des sous-produits tels que des acides gras volatils et des métabolites pour maintenir la santé de l’hôte.

Pour leur étude, les chercheurs ont collecté un total de 70 échantillons de selles de 14 juments et leurs poneys dans cinq haras de la Nouvelle-Galles du Sud, en Australie, âgés de la naissance à cinq mois.

Des méthodes moléculaires ont été utilisées pour évaluer la structure communautaire des micro-organismes. Les chercheurs ont ensuite recherché les effets de l’âge et de la localisation sur sa composition.

Les chercheurs ont découvert que l’âge au moment de l’échantillonnage avait un effet significatif sur le microbiote fécal et bactérien du poulain, tandis que l’effet de la localisation géographique était plus faible mais toujours significatif.

Ils ont rapporté que « l’abondance, la diversité et la richesse globales des assemblages bactériens et archéens augmentaient avec l’âge pour les poulains, le plus significativement plus élevé chez les poulains de 1 à 2 et 2 à 3 mois. »

Les bactéries les plus courantes isolées à partir d’échantillons de fèces de poulain appartiennent principalement à paquet Division.

Les 15 espèces de champignons les plus abondantes étaient toutes du phytoplancton écologique, les plus influencées par l’emplacement géographique plutôt que par l’âge au moment de l’échantillonnage. Les plantes à lancer vivent de matières organiques mortes ou en décomposition. Il y a eu un effet du site sur les champignons Breussie Africaine L’interaction entre la localisation et l’âge des espèces fongiques prix persicaEt le Acrémonium furcatumEt le pseudopodospora.

L’équipe d’étude n’a trouvé aucun effet de l’âge ou de l’emplacement sur l’abondance relative des espèces fongiques restantes.

Ils rapportent que pour la plupart des genres bactériens et archéens, le microbiome fécal semble être stable pendant deux à trois mois, comme une jument adulte.

En général, la communauté microbienne s’est installée dans l’intestin postérieur des poulains âgés de trois à quatre mois.

« L’augmentation de la diversité bactérienne à mesure que les poulains vieillissent coïncide probablement avec une exposition environnementale accrue par le biais de changements de régime alimentaire et d’interactions avec d’autres animaux », ont-ils déclaré.

À quelques exceptions près, les échantillons de juments adultes avaient tendance à se regrouper, tout comme les échantillons de poulains dans chaque groupe d’âge, quelle que soit la situation géographique.

Les auteurs ont déclaré avoir été surpris par l’abondance d’espèces aérobies trouvées, car ils s’attendaient principalement à des organismes anaérobies en raison de l’environnement caecum à faible teneur en oxygène.

L’âge au moment de l’échantillonnage avait un effet plus significatif sur les microbes fécaux primitifs et bactériens que sur la localisation géographique. Cependant, le contraire a été constaté pour les espèces fongiques.

Il est à noter, ont-ils dit, que les 15 espèces de champignons les plus abondantes étaient des saprophytes relativement écologiques. « Par conséquent, il était plus difficile d’établir la connexion de ces champignons en tant que colonisateurs de l’intestin postérieur. »

Ils concluent que les champignons écologiques et nutritionnels qui peuvent survivre à la digestion et maintenir une abondance relativement élevée peuvent avoir surpassé les populations anaérobies « essentielles » reconnues telles que Néocallimastigomycota.

L’absence générale d’influence de l’emplacement sur les populations microbiennes observée dans l’étude, ont-ils déclaré, indique que bien que les facteurs environnementaux puissent influencer la structure de la population, il existe des différences claires à chaque étape de la maturation du poulain.

L’équipe d’étude était composée d’O’Reilly, Katharine Muscat, Gary Muscatello et Alex Chaves, tous de l’Université de Sydney ; Mariano Barra et Sarah Mill de l’Université du Queensland ; et Devin Holman, d’Agriculture et Agroalimentaire Canada.

Grace C. O’Reilly, Devin B. Holman, Catherine Muscat, Gary Moscatelo, Mariano C. Barra, Sarah J. Mill, Alex F. Chaves. Caractérisation du microbiome fécal des poulains de 0 à 5 mois et de leurs juments considérées dans cinq zones géographiques. Devant moi. Bewsky. (Éd. Élite) 2022, 14(3), 22. https://doi.org/10.31083/j.fbe1403022

L’étude publiée sous Licence CCpeut être lu par ici.