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L’imagerie photothermique dans l’infrarouge moyen informatique révèle des agrégats de tau intracellulaires

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L’imagerie photothermique dans l’infrarouge moyen informatique révèle des agrégats de tau intracellulaires

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Schéma de chimio-imagerie 3D avec une pompe à sonde. b Schéma de reconstruction de carte RI 3D. c cas « froid » : imagerie sans faisceau de pompe moyen infrarouge ; Condition « chaud » : imagerie avec un faisceau de pompe dans l’infrarouge moyen. d Exemple de résultats de reconstruction. e Imagerie d’intensité de fluorescence 2D. f Génération de spectres d’empreintes digitales dans l’infrarouge moyen résolus en profondeur et analyse spectrale de la structure secondaire de la protéine concernée. g Visualisation 3D de la structure secondaire de la protéine. Crédit : Jian Zhao, Lulu Jiang, Alex Matlock, Weihong Xu, Jiabi Zhu, Hongbo Zhu, Li Tian, ​​​​Benjamin Luzhen et Ji Xinqing

En tant que forme prédominante de la protéine amyloïde, les enchevêtrements de tau sont devenus un axe majeur de recherche pour découvrir les mécanismes sous-jacents à la neurodégénérescence. Différents types d’agrégats de tau, y compris les fibres de tau et les oligomères, sont impliqués dans un large éventail de maladies neurodégénératives. Cependant, le mécanisme de formation des agrégats tau et les voies pathologiques associées restent mal compris.

L’étude de l’agrégation de tau nécessite des outils d’imagerie chimique à haute résolution capables de caractériser les agrégations intracellulaires volumétriques de tau dans leurs environnements natifs. Plusieurs méthodes ont été développées pour cela, telles que la cristallographie aux rayons X, la cryo-microscopie électronique (Cryo-EM), la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire, la spectroscopie de dichroïsme circulaire et la spectroscopie infrarouge basée sur la microscopie à force atomique.

Ces méthodes ont fait de grands progrès dans la caractérisation de différents types de protéines amyloïdes, y compris les agrégats tau. Cependant, les solutions actuelles sont fondamentalement limitées par leur incapacité à fournir une spectroscopie volumétrique spécifique au site et une imagerie 3D des assemblages de protéines intracellulaires dans leurs états cellulaires natifs. Par conséquent, le défi de restaurer les informations chimiques 3D des assemblages de protéines intracellulaires dans leurs environnements cellulaires d’origine reste un obstacle important.

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Dans un article récent sur La science de la lumière et ses applicationsLe Dr Ji-Xin Cheng du Photonics Center de l’Université de Boston, le Dr Jian Zhao (ancien membre du Cheng Lab de l’Université de Boston) du Bequewer Institute for Learning and Memory du MIT, le Dr Benjamin Louzen de la FT-Boston University School of Medicine et le Dr. Li Tian du Département d’électricité et de génie de l’Université de Boston et leurs collègues ont développé un microscope optique infrarouge (IR moyen) guidé par ordinateur connu sous le nom de fluorescence guidée par Bond. Tomographie sélective par aberration d’intensité (FBS-IDT). FBS-IDT intègre l’imagerie bidimensionnelle par fluorescence à photon unique dans la tomographie par diffraction pulsée à intensité MIP. Cette technologie innovante permet l’imagerie chimique 3D spécifique aux molécules et la spectroscopie infrarouge moyen spécifique au site des fibres tau intracellulaires dans le fluide intercellulaire.

Plus précisément, FBS-IDT permet une extraction efficace des informations chimiques concernant des groupes de protéines sélectionnés à partir de signaux protéiques de fond dans les fluides cellulaires. L’imagerie spectrale 3D de FBS-IDT peut atteindre une vitesse élevée (~ 0,05 Hz, jusqu’à ~ 6 Hz) et une haute résolution (~ 350 nm horizontal, ~ 1,1 µm axial). Tirant parti de la capacité de l’imagerie de chimiotaxie hyperspectrale 3D, FBS-IDT démontre la relation possible entre les fibres tau et l’accumulation de lipides. Notamment, cette technique est capable d’extraire des spectres d’empreintes digitales dans l’infrarouge moyen résolus en profondeur et de visualiser la structure secondaire des protéines des fibrilles tau intracellulaires dans l’espace 3D.

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Les scientifiques ont souligné l’importance et les avantages de la technologie FBS-IDT : « FBS-IDT surmonte les défis associés à l’imagerie chimique 3D des grappes de protéines amyloïdes intracellulaires et de leurs structures secondaires de protéines dans des environnements liquides. Cette réalisation est obtenue grâce à un dépistage sans balayage. Conception modulaire utilisant la microscopie de terrain Incandescence à faible coût avec des sources lumineuses supplémentaires. Le coût du système FBS-IDT est au moins 30 fois inférieur à celui des dernières méthodes de microscopie électronique, telles que Cryo-EM, et entraîne des frais d’exploitation négligeables. Ce plateau de table abordable convient à une utilisation de routine dans la plupart des environnements de laboratoire.  »

« Notre technique n’impose aucune limitation supplémentaire sur les échantillons biologiques, ouvrant ainsi une nouvelle voie pour l’imagerie in vivo des assemblages de protéines intracellulaires. De plus, notre méthode est basée sur une conception modulaire qui peut être facilement adaptée pour répondre à diverses exigences d’imagerie. Nous croyons fermement que le FBS-Our IDT pourrait apporter de nouvelles contributions à la recherche sur la neurodégénérescence et à diverses applications biomédicales. » Les scientifiques ont ajouté.

Plus d’information:
Jian Zhao et al, Imagerie chimique infrarouge des fibres tau intracellulaires à l’aide de la microscopie photothermique computationnelle guidée par fluorescence, Lumière : science et applications (2023). DOI : 10.1038/s41377-023-01191-6

Informations sur la revue :
Lumière : science et applications


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Des scientifiques explorent un système à trois étoiles inspiré de la science-fiction – RADII

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Des scientifiques explorent un système à trois étoiles inspiré de la science-fiction – RADII

Inspirés par les travaux de l’écrivain de science-fiction Liu Cixin, des scientifiques chinois ont révélé des détails jusqu’alors inconnus sur le système à triple étoile, qui est similaire au système à triple étoile fictif décrit dans le roman à succès de Liu. Le problème des trois corps.

Le roman, qui a lancé la renaissance de la science-fiction chinoise, aborde une question presque insurmontable qui interpelle les chercheurs depuis des années : comment prédire le mouvement de trois corps célestes les uns par rapport aux autres. Beaucoup disent que cela est impossible, car lorsqu’un système implique plus de deux corps, il a tendance à devenir rapidement chaotique.

Des scientifiques de trois universités chinoises ont mené une étude sur un système d’étoiles triples du monde réel appelé GW Orionis, situé à environ 1 300 années-lumière de la Terre, en utilisant les données d’observation de la NASA pour suivre les changements dans la luminosité des étoiles.

Cette recherche fournit des informations précieuses sur la géométrie et l’évolution des systèmes à trois étoiles, a déclaré le chercheur principal Tian Haijun. Ces résultats, publiés dans la revue à comité de lecture Science Chine Physique, Mécanique et Astronomieprésente un intérêt particulier en raison de la complexité et de l’imprévisibilité des interactions entre plusieurs étoiles.

Tian a expliqué qu’un système multi-étoiles se forme lorsque des nuages ​​massifs s’effondrent sous l’effet de la gravité, donnant naissance à deux étoiles ou plus.

« Leurs mouvements et interactions peuvent devenir si complexes que si la vie avait existé là-bas, elle aurait pu être détruite et renaître plusieurs fois », explique Tian. Dire Journal du matin de Chine du Sud.

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Les chercheurs ont découvert que plusieurs étoiles de ce système tournent à une vitesse relativement élevée, avec une période de rotation d’environ deux à trois jours.

« Des rotations aussi rapides sont typiques des très jeunes étoiles et diffèrent de notre Soleil, qui tourne tous les 25 jours. » dit Tian.

Étonnamment, les systèmes à étoiles multiples constituent en réalité la norme dans notre univers, alors que les systèmes solaires à une seule étoile comme le nôtre constituent l’anomalie. La plupart des étoiles de l’univers sont accompagnées d’au moins un partenaire.

« Bien que de tels systèmes soient difficiles à observer, nous prévoyons d’utiliser des télescopes plus avancés, notamment le prochain télescope de la Station spatiale chinoise (CSST), pour mieux comprendre comment ils se forment et se comportent. »

Une fois qu’il sera prêt à fonctionner en orbite terrestre basse, Tian et ses collègues chercheurs prévoient d’utiliser le CSST, équipé d’un spectromètre de champ intégré à haute résolution, pour effectuer des mesures plus précises.

Image de couverture via UnsplashImage supplémentaire via Wikimédia Commons

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Mécanisme de la méthyltransférase médiée par METTL8 | Alerte Yorick !

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Mécanisme de modification et spécificité du substrat de METTL8

Image : L’extension N de METTL8-Iso1 est critique pour la biogenèse de m3C32 tandis que METTL8-Iso4 est inactif dans l’activité de modification de m3C32 en raison de l’absence de l’extension N. METTL8-Iso1 a montré une spécificité de substrat d’ARNt pratique pour la modification de plusieurs cytoplasmiques ou même l’ARNt bactérien.
Paysage plus

Crédit : © Presse scientifique chinoise

Cette étude a été dirigée par le Pr. Xiaolong Zhu et En-Due Wang (Centre d’excellence CAS en science cellulaire moléculaire, Institut de biochimie et de biologie cellulaire de Shanghai, Académie chinoise des sciences).

L’ARNT (ARNt) est une molécule adaptatrice clé dans la traduction de l’ARNm. Il existe un grand nombre de modifications post-transcriptionnelles de l’ARNt, qui régulent la vitesse et la précision de la synthèse des protéines. 3-méthylcytosine (m3c) La modification est largement présente en position 32 (m3C32) des boucles anticodon de nombreux ARN cytoplasmiques et mitochondriaux chez les eucaryotes.

Une étude précédente menée par le même laboratoire a révélé que M3La modification C32 des ARNt cytoplasmiques humains est médiée par METTL2A/2B et METTL6, tandis que la modification C32 des ARNt dans les mitochondries humaines est médiée.Ème (HmtrnnaÈme) et ARNtSecrète(UCN) (HMTRNASecrète(UCN)) est stimulé par METTL8 ; Humains Métal8 Il génère deux isoformes de la protéine de longueurs différentes par épissage alternatif de l’ARNm. La forme longue, METTL8-Iso1, a été ciblée dans les mitochondries pour la stimulation cellulaire.3Modification C32 de l’hématronÈme Et il nous a murmuréSecrète(UCN); Tandis que la forme courte, METTL8-Iso4, est située dans le noyau avec une fonction inconnue. La seule différence entre les deux isoformes est le peptide d’extension N-terminal de 28 acides aminés dans METTL8-Iso1. Si METTL8-Iso4 contient m3Activité de la C32 méthyltransférase et rôle de l’extension N-terminale de METTL8-Iso1 dans l’ARNt m mitochondrial3Modification C32 inconnue. On ne sait pas non plus si elle est cytoplasmique ou mitochondriale.3Les enzymes de modification C32 peuvent reconnaître les ARNt de différents compartiments cellulaires. De plus, puisque la plupart des ARNmt m3Nécessite des modifications C32 n6– Modification threonylcarbamoyl adénosine en position 37 (R6A37) Dans la boucle anticodon, préparer au préalable des molécules d’ARNt contenant uniquement m3La modification C32 n’a pas été entièrement réalisée.

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Pour répondre à ces questions, les chercheurs ont confirmé la conservation de l’extension N-terminale (N-extension) de METTL8-Iso1 grâce à un alignement de séquences multiples. dans le laboratoire La détermination de l’activité enzymatique a révélé que METTL8-Iso4 ne contient pas de m3Activité de modification C32. Ils ont également démontré que l’extension N de METTL8-Iso1 servait d’élément clé de liaison à l’ARNt dans le processus catalytique. Deux résidus d’acides aminés complètement conservés ont été identifiés dans toutes les protéines METTL2A/2B/8. METTL8-Iso1 a pu jouer le rôle de médiateur m3Modification C32 du cytoplasme et bactérie coli Les ARNt, qui ne dépendaient pas de t6A37. Cependant, le cytoplasme de M3Les enzymes de modification C32 METTL2A et METTL6 n’ont pas pu catalyser m3Modification C32 de l’ARNt mitochondrial, suggérant que METTL8-Iso1 a une spécificité de substrat plus relâchée. ils3La modification C32 n’a pas affecté t6Niveaux de modification A37 et d’aminoacylation de l’ARNhtÈme. Enfin, ils ont également révélé que METTL8-Iso1 interagissait respectivement avec la séryl-ARNt synthétase mitochondriale (SARS2) et la thréonyl-ARNt synthétase mitochondriale (TARS2), et améliorait de manière significative l’activité d’aminoacylation de SARS2 et TARS2.

En résumé, ce travail révèle le mécanisme moléculaire de l’ARNt mitochondrial m3Biogenèse C32 médiée par METTL8, qui repose sur une extension N-terminale spécifique comme motif majeur de liaison à l’ARN. METTL8 avait une large gamme de Hétérogène Substrats d’ARNt, qui ont servi de base à la préparation d’ARNt contenant uniquement de l’AM3C anion. Ce travail fournit une compréhension globale de la conservation et de la différence entre les ARNt m cytoplasmiques et mitochondriaux.3Modifier c.

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La NASA ouvre la boîte d’échantillons d’astéroïdes OSIRIS-REx (photos)

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La NASA ouvre la boîte d’échantillons d’astéroïdes OSIRIS-REx (photos)

La caisse d’échantillons d’astéroïdes d’OSIRIS-REx a été ouverte pour la première fois depuis plus de sept ans.

Des scientifiques du Johnson Space Center (JSC) de la NASA à Houston ont soulevé le couvercle extérieur de la cartouche mardi 26 septembre, deux jours après l’atterrissage de la capsule de retour OSIRIS-REx dans le désert du nord de l’Utah.

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