Nouveaux virus liés à la fois aux virus géants et aux virus de l’herpès

Les données métagénomiques des océans Tara sur le plancton ont permis la découverte d’un grand groupe de virus à ADN abondant de l’équateur aux pôles : les mirusvirus. Ces virus jouent un rôle dans la régulation du plancton en infectant un grand nombre d’organismes unicellulaires à tout moment.

Ils sont très complexes avec une constitution génomique surprenante : les gènes clés de la formation de leur particule virale, caractéristique de ces virus à ADN, ont un lien évolutif direct avec les herpesvirus. Ce dernier est fréquent chez les animaux (la moitié de la population mondiale est infectée par le virus de l’herpès) mais n’est pas présent dans d’autres formes de vie, laissant sans réponse la question de leur origine évolutive.

La découverte des mirusvirus indique que les ancêtres des herpèsvirus infectaient les organismes unicellulaires marins. L’histoire évolutive des virions réserve d’autres surprises. Malgré le lien apparent avec les herpèsvirus, la majorité des gènes des mirusvirus, y compris ceux impliqués dans la reproduction des génomes viraux, sont similaires à ceux des virus géants, un groupe viral complètement distinct qui intrigue les scientifiques avec ses caractéristiques surprenantes. Cette « chimère » évolutive chez les mirusvirus est unique et peut fournir des informations sur l’évolution des virus à ADN.

« En 2019, notre équipe de recherche a remarqué un signal évolutif inhabituel dans les vastes quantités de données de séquence fournies par le projet Tara Oceans. En suivant ce signal, nous avons découvert puis caractérisé un grand groupe de virus à ADN : les mirusvirus. Cette découverte a été publiée dans nature Il marque le début d’une nouvelle aventure et une porte d’entrée pour la communauté scientifique pour découvrir et étudier les virions de virus dans un certain nombre d’écosystèmes », explique Tom Delmont, expert en écologie microbienne au Centre national de la recherche scientifique et auteur récent de l’étude. .

« Tara Oceans a changé notre compréhension de l’écologie du plancton. Notre étude prouve que cette incroyable expédition apporte également des réponses à des questions évolutives fondamentales. Il reste encore beaucoup à découvrir et à comprendre sur les mirusvirus. Ils ne sont pas encore cultivés, et il n’existe pas d’images de leur particule virale », a déclaré Morgan Jaya, expert en évolution virale. Au CEA et premier auteur :

En savoir plus sur l’Expédition Tara Océan (2009-2013)

Depuis près de quatre ans, la goélette Tara a navigué dans tous les bassins océaniques avec une mission unique : obtenir une image globale des écosystèmes planctoniques à travers le monde. Cette biodiversité méconnue et invisible est un marqueur important de la santé de notre planète et de son système climatique. Près de 35 000 échantillons de virus, bactéries, algues et plancton ont été collectés et analysés et sont toujours en cours d’analyse.

Le plus grand effort de séquençage génétique jamais entrepris sur un écosystème marin, l’expédition a mis en lumière la majorité des gènes microbiens jusqu’alors inconnus. En collaboration avec la Fondation Tara Océan, cette campagne a mobilisé principalement des équipes du CNRS, du CEA et de l’EMBL, membres du consortium Tara Oceans et du réseau de recherche GO-SEE (Global Ocean Systems Ecology and Evolution).