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Un nouveau logiciel permet aux utilisateurs aveugles et malvoyants de créer des graphiques interactifs accessibles | Actualités du MIT

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Un nouveau logiciel permet aux utilisateurs aveugles et malvoyants de créer des graphiques interactifs accessibles |  Actualités du MIT

Il existe un nombre croissant d'outils permettant aux utilisateurs de fournir des représentations en ligne de données, telles que des graphiques, accessibles aux personnes aveugles ou malvoyantes. Cependant, la plupart des outils nécessitent une présentation visuelle existante qui peut ensuite être convertie dans un format accessible.

Cela crée des obstacles qui empêchent les utilisateurs aveugles et malvoyants de créer leurs propres représentations de données personnalisées et peut limiter leur capacité à explorer et analyser des informations importantes.

Une équipe de chercheurs du MIT et de l’University College London (UCL) souhaite changer la façon dont les gens envisagent la représentation des données accessibles.

Ils ont créé un système logiciel appelé environnement (qui signifie « environnement » en allemand) qui peut permettre aux utilisateurs aveugles et malvoyants de créer des représentations de données personnalisées et multimodales sans avoir besoin d'une présentation visuelle initiale.

Umwelt, un environnement de création conçu pour les utilisateurs de lecteurs d'écran, comprend un éditeur qui permet à quelqu'un de télécharger un ensemble de données et de créer une représentation personnalisée, telle qu'un nuage de points, qui peut inclure trois modalités : visualisation, description textuelle et sonification. La sonification consiste à convertir des données en sons non vocaux.

Le système, qui peut représenter une variété de types de données, comprend un visualiseur qui permet à un utilisateur aveugle ou malvoyant d'explorer de manière interactive la représentation des données, en passant de manière transparente entre chaque manière d'interagir avec les données d'une manière différente.

Les chercheurs ont mené une étude auprès de cinq utilisateurs experts de lecteurs d’écran qui ont trouvé Umwelt utile et facile à apprendre. En plus d’offrir une interface leur permettant de créer des représentations de données – ce qui, selon eux, manquait cruellement – ​​les utilisateurs ont déclaré qu’Umwelt pourrait faciliter la communication entre des personnes qui s’appuient sur différents sens.

« Nous devons nous rappeler que les personnes aveugles et malvoyantes ne sont pas isolées. Elles se trouvent dans ces contextes où elles veulent parler de données à d'autres personnes », explique Jonathan Zhong, étudiant diplômé en génie électrique et informatique (EECS) et auteur principal. du papier. Fiche de présentation d'Umwelt. « J'espère qu'Umwelt contribuera à changer la façon dont les chercheurs envisagent l'analyse des données accessibles. Permettre la pleine participation des personnes aveugles et malvoyantes à l'analyse des données implique de considérer la visualisation comme une seule pièce de ce puzzle multisensoriel plus vaste. »

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Zhong est rejoint dans cet article par Isabella Pedraza Pineros et Mingzhou « Katie » Chen, étudiantes diplômées de l'EECS ; Daniel Hagas, chercheur à l'University College London travaillant avec le Global Centre for Disability Innovation ; Et l'auteur principal Arvind Satyanarayan, professeur agrégé d'informatique au MIT qui dirige le groupe de visualisation du laboratoire d'informatique et d'intelligence artificielle. Le document sera présenté à la conférence ACM sur les facteurs humains en informatique.

Visualisation décentralisée

Les chercheurs ont déjà développé des interfaces interactives qui offrent une expérience plus riche aux utilisateurs de lecteurs d’écran lorsqu’ils explorent les représentations de données accessibles. Grâce à ce travail, ils ont réalisé que la plupart des outils nécessaires pour créer de telles représentations impliquent de transformer des schémas visuels existants.

Dans le but de réduire la représentation visuelle dans l'analyse des données, Zhong et Hagas, qui ont perdu la vue à l'âge de 16 ans, ont commencé à concevoir Umwelt il y a plus d'un an.

Premièrement, ils ont réalisé qu’ils devraient repenser la façon dont ils représentaient les mêmes données à l’aide de modèles visuels, audio et textuels.

« Nous avons dû trouver un dénominateur commun derrière les trois approches », explique Hagas. « En créant ce nouveau langage de représentation et en rendant les résultats et les intrants accessibles à tous, le tout devient plus grand que la somme de ses parties. »

Pour construire Umwelt, ils ont d’abord pris en compte ce qui était unique dans la façon dont les gens utilisent chacun de leurs sens.

Par exemple, un utilisateur voyant peut voir le motif général d’un nuage de points et, en même temps, bouger ses yeux pour se concentrer sur différents points de données. Mais pour quelqu’un qui écoute la sonification, l’expérience est linéaire puisque les données sont converties en tonalités qui doivent être jouées les unes après les autres.

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« Si vous pensez uniquement à traduire directement les caractéristiques visibles en caractéristiques non visibles, vous passez à côté des forces et des faiblesses uniques de chaque méthode », ajoute Zhong.

Ils ont conçu Umwelt pour offrir de la flexibilité, permettant à l'utilisateur de basculer facilement entre les méthodes lorsque cela convient le mieux à sa tâche à un moment donné.

Pour utiliser l'éditeur, il faut télécharger un ensemble de données sur Umwelt, qui utilise des heuristiques pour créer automatiquement des représentations virtuelles dans chaque méthode.

Si l'ensemble de données contient les cours des actions d'entreprises, Umwelt peut créer un graphique linéaire multi-séries, une structure de texte qui regroupe les données par symbole boursier et par date, ainsi qu'un phonème qui utilise la longueur des tons pour représenter le prix de chaque date, organisé par ticker. symbole.

Les heuristiques par défaut sont destinées à aider l'utilisateur à démarrer.

« Dans tout type d'outil de création, vous obtenez un effet de page vierge où il est difficile de savoir par où commencer. Cela est encore plus vrai dans un outil multimédia car vous devez définir les choses dans trois représentations différentes », explique Zhong.

L'éditeur relie les interactions entre les méthodes, donc si l'utilisateur modifie la description textuelle, ces informations sont modifiées dans la sonification correspondante. N'importe qui peut utiliser l'éditeur pour créer une représentation multimédia, accéder au visualiseur pour une exploration initiale, puis revenir à l'éditeur pour effectuer des ajustements.

Aider les utilisateurs à communiquer des données

Pour tester Umwelt, ils ont créé diverses représentations multimédias, allant des nuages ​​de points aux graphiques à vues multiples, afin de garantir que le système puisse représenter efficacement différents types de données. Ils ont ensuite confié l’outil à cinq utilisateurs experts en lecteurs d’écran.

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Les participants à l’étude ont principalement trouvé Umwelt utile pour créer, explorer et discuter de représentations de données. Un utilisateur a déclaré qu’Umwelt servait de « catalyseur » réduisant le temps nécessaire à l’analyse des données. Les utilisateurs conviennent qu'Umwelt peut les aider à communiquer plus facilement des données avec des collègues voyants.

« Ce qui se démarque chez Umwelt, c'est sa philosophie fondamentale consistant à minimiser l'importance des éléments visuels au profit d'une expérience de données équilibrée et multisensorielle. Trop souvent, les représentations de données non visuelles sont reléguées au statut de considérations secondaires et ne sont que des ajouts à leurs homologues visuels. Cependant, la visualisation n'est qu'un aspect de la visualisation des données. « J'apprécie leurs efforts pour changer cette perception et adopter une approche plus holistique de la science des données », déclare Jo Young Seo, professeur adjoint au Collège des sciences de l'information à l'Université de l'Illinois à Urbana-Champaign, qui n'a pas participé à ces travaux.

À l’avenir, les chercheurs prévoient de créer une version open source d’Umwelt sur laquelle d’autres pourront s’appuyer. Ils souhaitent également intégrer la détection tactile dans le système logiciel en tant que méthode supplémentaire, permettant l'utilisation d'outils tels que des écrans graphiques tactiles actualisables.

« En plus de son impact sur les utilisateurs finaux, j'espère qu'Umwelt servira de plateforme pour poser des questions scientifiques sur la façon dont les gens utilisent et perçoivent les représentations multimodales, et sur la manière dont nous pouvons améliorer la conception au-delà de cette étape initiale », déclare Zhong.

Ce travail a été soutenu en partie par la National Science Foundation et la MIT Morningside Academy for Design Fellowship.

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Une exoplanète radioactive découverte lors d'une « tempête de marée parfaite »

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Une exoplanète radioactive découverte lors d'une « tempête de marée parfaite »

Les forces de marée peuvent-elles provoquer un rayonnement de chaleur à la surface d’une exoplanète ? C'est ce qu'un Étude récente acceptable pour Revue astronomique Une équipe de chercheurs internationaux espère traiter les données collectées à partir d’instruments au sol pour confirmer l’existence d’une deuxième exoplanète résidant au sein du système exoplanétaire. HD 104067, tout en utilisant la mission Transiting Exoplanet Survey Satellite (TESS) de la NASA pour identifier également une exoplanète candidate supplémentaire. Ce qui est unique à propos de cette planète candidate, qui orbite plus profondément que les deux autres, est que les forces de marée émergeant des deux exoplanètes les plus externes font probablement rayonner la surface de la candidate avec une température de surface atteignant 2 300 degrés Celsius (4 200 degrés). Fahrenheit), que les chercheurs appellent la « tempête de marée parfaite ».

ici, L'univers aujourd'hui Discute de cette recherche fascinante avec Dr Stephen Kane, professeur d'astrophysique planétaire à l'Université de Californie à Riverside et auteur principal de l'étude, concernant les motivations derrière l'étude, les résultats importants, l'importance des aspects de « tempête de marée » et des recherches de suivi, ainsi que les implications de ce système pour l'étude d'autres systèmes exoplanétaires. Alors, quelle était la motivation derrière cette étude ?

« L'étoile (HD 104067) était connue pour abriter une planète géante sur une orbite de 55 jours, et j'ai une longue histoire d'obsession pour les systèmes connus », explique le Dr Kane. L'univers aujourd'hui. «Lorsque TESS a détecté une planète potentielle en transit de la taille de la Terre sur une orbite de 2,2 jours (TOI-6713.01), j'ai décidé d'examiner plus en détail le système. Nous avons collecté toutes les données du vaisseau spatial et avons découvert qu'il y avait une autre planète (de masse Uranus) en orbite. sur une orbite de 13 jours. Cela a donc commencé avec les données TESS, et le système est devenu plus intéressant à mesure que nous l'étudiions.

L'histoire du Dr Kane dans la recherche sur les exoplanètes comprend d'innombrables structures du système solaire, en particulier celles contenant des exoplanètes très excentriques, mais comprend également des travaux de suivi après confirmation de la présence d'exoplanètes dans le système. Plus récemment, il fut le deuxième auteur de Stade Discussion sur la structure révisée du système HD 134606, ainsi que sur la découverte de deux nouvelles super-Terres au sein de ce système également.

Dans cette dernière étude, le Dr Kane et ses collègues ont utilisé les données des instruments HARPS (High Resolution Radial Velocity Planet Search), du spectromètre Echelle haute résolution (HIRES) et de la mission TESS susmentionnée pour vérifier les propriétés et les paramètres des deux. L'étoile mère, HD 105067, et les exoplanètes correspondantes en orbite autour d'elle. Cependant, outre la découverte d’exoplanètes supplémentaires au sein du système, comme le mentionne le Dr Kane, quels sont les résultats les plus importants obtenus par cette étude ?

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dit le Dr Kane L'univers aujourd'hui« Le résultat le plus surprenant de notre travail a été que la dynamique du système lui a fait subir des effets de marée massifs sur une période de 2,2 jours, similaires à ceux subis par Io. Cependant, dans ce cas, TOI-6713.01 subit une énergie de marée de 10 millions. fois supérieur à Io, ce qui donne 2600K. [2,300 degrees Celsius (4,200 degrees Fahrenheit)] Température superficielle. Cela signifie que la planète brille réellement aux longueurs d’onde de la lumière.

La lune de Jupiter, Io, est le corps planétaire le plus volcaniquement actif du système solaire, qui est produit par le réchauffement des marées provoqué par l'immense gravité de Jupiter tout au long de l'orbite légèrement excentrique (allongée) de 1,77 jours d'Io. Cela signifie que Io s'approche de Jupiter à certains points et s'en éloigne à d'autres points, provoquant respectivement la compression et l'expansion d'Io. Pendant des millions d'années, cette friction constante à l'intérieur d'Io a réchauffé son noyau, donnant naissance aux centaines de volcans qui composent la surface d'Io, ainsi qu'à l'absence de cratères d'impact visibles. Comme le note le Dr Kane, cette nouvelle exoplanète candidate « connaît 10 millions de fois plus d’énergie de marée que Io », ce qui pourrait soulever des questions supplémentaires concernant son activité volcanique ou d’autres processus géologiques. Par conséquent, quelle est la signification des aspects « tempête de marée » du TOI-6713.01 ?

dit le Dr Kane L'univers aujourd'hui« La raison pour laquelle TOI-6713.01 est soumis à de fortes forces de marée est due à l'excentricité des deux planètes géantes extérieures, forçant également TOI-6713.01 à se placer sur une orbite excentrique. Ainsi, j'ai fait référence à la planète comme étant prise dans une pleine tempête de marée. .»

Le système HD 104067 avec deux exoplanètes géantes forçant le TOI-6713.01 le plus intérieur dans une « tempête de marée parfaite » rappelle un peu les trois premières lunes galiléennes de Jupiter, Io, Europe et Ganymède, en ce qui concerne leurs influences gravitationnelles les unes sur les autres tout au long de leur vie. orbites. . Cependant, il existe quelques différences, puisque l'immense gravité de Jupiter est la principale force à l'origine de l'activité volcanique de Io, et que les trois lunes sont situées dans ce que l'on appelle Résonance orbitaleCe qui signifie que les orbites sont proportionnelles les unes aux autres. Par exemple, pour quatre orbites d'Io, il y a deux orbites d'Europe et une orbite de Ganymède, ce qui rend leur résonance orbitale 4:2:1, ce qui amène chaque lune à exercer des influences gravitationnelles régulières l'une sur l'autre. Ainsi, bien que l’aspect tempête de marée sur TOI-6713.01 soit causé par l’excentricité des géantes extérieures, comment cela se compare-t-il à la relation entre Io, Europe et Ganymède ?

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« La résonance de Laplace des lunes de Galilée crée une configuration particulièrement forte, car l'alignement régulier des trois lunes intérieures force régulièrement Io sur une orbite excentrique », explique le Dr Kane à Universe Today. « Le système HD 104067 n'est pas en résonance mais l'est. toujours capable de produire une configuration énergétique.

Comme mentionné, TOI-6713.01 a été découvert à l'aide de la méthode de la vitesse radiale, également connue sous le nom de spectroscopie Doppler, ce qui signifie que les astronomes ont mesuré de minuscules changements dans le mouvement de l'étoile mère lorsqu'elle était légèrement entraînée par la planète pendant l'orbite de cette dernière. Ces changements subtils font vaciller l'étoile mère lorsque les deux objets s'attirent, et les astronomes utilisent des spectrographes pour détecter les changements dans cette oscillation lorsque l'étoile se rapproche et s'éloigne de nous pour trouver des exoplanètes. Cette méthode s'est avérée très efficace pour trouver des exoplanètes Cela représente environ 20 pour cent Sur le nombre total d'exoplanètes confirmées jusqu'à présent, et La première exoplanète en orbite autour d’une étoile comme la nôtre Il a également été découvert grâce à cette méthode. Cependant, malgré l’efficacité de la vitesse radiale, l’étude note que TOI-6713.01 « n’a pas encore été confirmé », alors quelles observations supplémentaires seraient nécessaires pour confirmer son existence ?

dit le Dr Caines L'univers aujourd'hui« La planète étant si petite, elle est difficile à détecter à partir des données de vitesse radiale. Cependant, le transit semble propre et nous avons exclu la possibilité d'une contamination stellaire supplémentaire, mais nous sommes tout à fait convaincus que la planète existe à ce stade. .»

Cette étude intervient alors que le nombre total de systèmes exoplanétaires s'élève à environ 4 200, avec un nombre d'exoplanètes confirmées supérieur à 5 600 et plus de 10 100 exoplanètes candidates également en attente de confirmation. Il a été constaté que ces structures de système diffèrent considérablement de notre système solaire, qui est constitué de planètes telluriques (rocheuses) les plus proches du Soleil et de géantes gazeuses situées sur des orbites beaucoup plus éloignées. Les exemples comprennent Jupiter chaud Cette orbite dangereusement proche de leur étoile mère, certains en quelques jours seulement, et d'autres systèmes Il comprend sept exoplanètes de la taille de la Terreet certains d'entre eux tournent à l'intérieur Zone habitable. Alors, que peut nous apprendre cette structure unique du système solaire sur les systèmes exoplanétaires en général, et que reflètent les autres systèmes exoplanétaires ?

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dit le Dr Kane L'univers aujourd'hui« Ce système est un excellent exemple des environnements extrêmes dans lesquels les planètes peuvent se trouver. Il y a eu plusieurs cas de planètes telluriques proches de leur étoile et chauffées par l'énergie de l'étoile, mais très peu de cas où l'énergie marémotrice fait fondre la planète. l'intérieur. »

La découverte potentielle d'une exoplanète en orbite dans une « tempête de marée parfaite » illustre une myriade de caractéristiques que présentent les exoplanètes et les systèmes exoplanétaires, tout en contrastant avec notre propre système solaire et ce que les astronomes en ont appris jusqu'à présent. S'il est confirmé, TOI-6713.01 continuera de façonner notre compréhension de la formation et de l'évolution des exoplanètes et des systèmes exoplanétaires, non seulement dans notre Voie lactée, mais également dans tout l'univers.

« L'univers est un endroit merveilleux ! » dit le Dr Kane L'univers aujourd'hui. « Ce qui est amusant dans ce projet en particulier, c'est que tout a commencé par « Hmm… ça pourrait être intéressant » et s'est ensuite transformé en quelque chose de bien plus fascinant que ce que j'aurais pu imaginer. Allez voir le spectacle, ne manquez jamais l'occasion de le faire ! poursuivez votre curiosité.

Comment cette exoplanète de tempête de marée nous apprendra-t-elle sur les exoplanètes et autres systèmes exoplanétaires dans les années et décennies à venir ? Seul le temps nous le dira, c'est pourquoi nous étudions !

Comme toujours, continuez à faire de la science et continuez à rechercher !

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Les astronomes présentent un nouveau modèle pour la formation de planètes « flottantes » récemment découvertes

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Les astronomes présentent un nouveau modèle pour la formation de planètes « flottantes » récemment découvertes

La découverte récente d’une nouvelle classe potentielle de planètes lointaines et mystérieuses « flottantes » a suscité l’intérêt des astronomes depuis que de nouvelles images époustouflantes prises par le télescope spatial James Webb ont été partagées à la fin de l’année dernière.

Ces planètes candidates, connues sous le nom d'objets binaires de masse Jupiter (JuMBO), semblent tourner autour les unes des autres car elles flottent librement dans l'espace, sans être attachées à aucune étoile, ce qui contredit les théories dominantes sur le fonctionnement des systèmes planétaires.

Aujourd'hui, une nouvelle étude révolutionnaire réalisée par une équipe d'astrophysiciens de l'UNLV et de l'Université de Stony Brook a été publiée le 19 avril dans la revue Astronomie naturelleIl fournit un modèle convaincant de la façon dont ces organismes massifs se sont formés.

L’équipe a utilisé des techniques avancées, connues sous le nom de simulations directes à N corps, pour explorer comment les interactions au sein d’amas d’étoiles denses pourraient éjecter des planètes géantes qui restent liées entre elles par la gravité lorsqu’elles dérivent à travers la galaxie. Cette recherche importante fournit un modèle sur la façon dont ces mystérieux binaires se forment, comblant ainsi une lacune critique dans notre compréhension de l’évolution planétaire.

« Nos simulations montrent que des rencontres stellaires rapprochées pourraient éjecter spontanément des paires de planètes géantes de leurs systèmes d'origine, les obligeant à orbiter l'une autour de l'autre dans l'espace », a déclaré l'auteur de l'étude Yihan Wang, chercheur postdoctoral au Centre d'astrophysique du Nevada à l'UNLV. « Ces résultats pourraient changer radicalement notre perception de la dynamique planétaire et de la diversité des systèmes planétaires de notre univers. »

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La recherche indique que de tels événements sont plus susceptibles de se produire au sein d’amas d’étoiles densément peuplés, ce qui suggère que les planètes binaires flottantes pourraient être plus courantes qu’on ne le pensait auparavant. Les propriétés de ces paires planétaires, telles que leur séparation et leur excentricité orbitale, fournissent de nouvelles informations sur les conditions environnementales violentes qui influencent la formation des planètes.

« Il présente les interactions stellaires dynamiques comme un facteur important dans le développement de systèmes planétaires inhabituels dans des environnements stellaires denses », a déclaré Rosalba Perna, co-auteur de l'étude et professeur de physique et d'astronomie à l'Université de Stony Brook.

Selon les chercheurs, ces nouveaux travaux élargissent nos connaissances sur la formation planétaire et ouvrent également la voie à de futures observations utilisant le télescope spatial James Webb (JWST), qui pourraient fournir davantage de preuves à l'appui des prédictions de l'équipe.

« Comprendre la formation d'objets massifs nous aide à remettre en question et à améliorer les théories dominantes sur la formation planétaire », a déclaré Zhaohuan Zhu, astrophysicien à l'UNLV et co-auteur de l'étude. « Les observations du télescope spatial James Webb peuvent nous aider à y parvenir, en fournissant de nouvelles informations avec chaque observation qui nous aideront à mieux formuler de nouvelles théories sur la formation des planètes géantes. »

À propos du papier

« Planètes binaires flottant librement suite à leur éjection lors de rencontres stellaires rapprochées», a été publié le 19 avril dans le magazine Astronomie naturelle.

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Aperçu de la croissance des plantes et des maladies humaines

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Un criblage de suppresseur génétique identifie le RdDM comme une voie majeure pour le silençage épigénétique induit par une expansion répétée. une, Phénotypes (indiqués par leurs identifiants d'écran d'origine) des suppresseurs isolés par rapport à Bur-0. Les feuilles irrégulièrement faibles sont marquées par des flèches blanches chez le type sauvage Bur-0. Barres d'échelle, 2 cm. Brelatif III1 Niveaux d'expression de suppresseurs de gènes identifiés par criblage génétique. Les nombres représentent les identifiants d'écran d'origine et les gènes correspondants identifiés après le clonage sont indiqués ci-dessous. Niveaux d'expression moyens basés sur trois répétitions biologiques pour chaque lignée (à l'exclusion de Bur-0 et fug1n = 5 et 4, respectivement). Astérisques Indiquez les points de données individuels. sLes valeurs sont basées sur une analyse de variance unidirectionnelle avec le test post hoc de Tukey, et les polices avec des lettres différentes sont significativement différentes les unes des autres (s <0,05). Les barres d'erreur représentent s.e.mC Exemple d'analyse SHOREmap utilisant 44-2 Définit une mutation dans Paul F. . Les allèles à haute fréquence (> 0,85) sont colorés en rouge et les croix rouges représentent les allèles causals putatifs. crédit:Plantes naturelles

(2024). est ce que je: 10.1038/s41477-024-01672-5 ×

Fermer Un criblage de suppresseur génétique identifie le RdDM comme une voie majeure pour le silençage épigénétique induit par une expansion répétée.une , Phénotypes (indiqués par leurs identifiants d'écran d'origine) des suppresseurs isolés par rapport à Bur-0. Les feuilles irrégulièrement faibles sont marquées par des flèches blanches chez le type sauvage Bur-0. Barres d'échelle, 2 cm.B relatif III1 Niveaux d'expression de suppresseurs de gènes identifiés par criblage génétique. Les nombres représentent les identifiants d'écran d'origine et les gènes correspondants identifiés après le clonage sont indiqués ci-dessous. Niveaux d'expression moyens basés sur trois répétitions biologiques pour chaque lignée (à l'exclusion de Bur-0 et fug1 n = 5 et 4, respectivement). Astérisques Indiquez les points de données individuels.sLes valeurs sont basées sur une analyse de variance unidirectionnelle avec le test post hoc de Tukey, et les polices avec des lettres différentes sont significativement différentes les unes des autres ( s<0,05). Les barres d'erreur représentent s.e.m C Exemple d'analyse SHOREmap utilisant 44-2Définit une mutation dans Paul F.. Les allèles à haute fréquence (> 0,85) sont colorés en rouge et les croix rouges représentent les allèles causals putatifs. crédit:

Plantes naturelles (2024). est ce que je: 10.1038/s41477-024-01672-5 Les biologistes de l'Université Monash ont mis en lumière les mécanismes moléculaires complexes responsables de l'inactivation des gènes provoquée par des répétitions étendues dans une étude internationale. publiéaujourd'hui dans

Plantes naturelles

.

Ce phénomène a été associé à un certain nombre de maladies génétiques, notamment l'ataxie de Friedreich chez l'homme, et provoque des anomalies de développement chez des plantes telles qu'Arabidopsis thaliana.

La recherche vise à comprendre le mécanisme par lequel les répétitions amplifiées provoquent l’inactivation des gènes, une procédure clé pour contrôler l’expression des gènes.

Les nouveaux composants nécessaires à ce processus de mise au silence ont été découverts par des chercheurs à l'aide d'un modèle végétal qui présente des symptômes de défauts de croissance à des températures plus élevées mais pas à des températures plus basses.

La protéase SUMO FUG1, le lecteur d'histone AL3 et la protéine chromodomaine LHP1 ont été identifiés comme les trois acteurs les plus importants, selon l'étude.

« Ces protéines se réunissent pour créer une unité de base requise pour l'inactivation des gènes résultant d'une expansion répétée », a déclaré le Dr Sridevi Sureshkumar, auteur principal de l'étude, qui dirige le groupe de recherche génétique du groupe de recherche fondamentale de l'école des sciences biologiques de l'université Monash.

« Notre recherche révèle le rôle essentiel que jouent ces protéines dans la coordination de l'inactivation génique résultant de répétitions étendues », a déclaré le Dr Sureshkumar.

« La connaissance de ces systèmes fait non seulement progresser notre compréhension de la biologie végétale, mais donne également un aperçu des maladies humaines », a-t-elle déclaré.

Au cours de la recherche, des méthodes modernes de criblage génétique et des tests à deux hybrides sur levure ont été utilisés afin de déterminer que FUG1, une protéase SUMO non caractérisée, joue un rôle important dans l’inactivation des gènes. Après une analyse plus approfondie, il a été démontré que FUG1 interagissait avec AL3, un lecteur d'histone connu pour se lier à des marques d'histone spécifiques associées à une expression génique efficace.

De plus, les chercheurs ont découvert que la protéine AL3 interagit avec LHP1, une protéine chromodomaine qui joue un rôle dans la propagation des marques d'histone restreintes. L'inversion de l'inactivation des gènes et la suppression des symptômes associés à une expansion récurrente se sont produites en raison de la perte de fonction de l'un de ces composants au cours de l'expérience.

« Ces résultats mettent en valeur l’importance des modificateurs post-traductionnels et des lecteurs d’histone dans la régulation épigénétique », a déclaré le Dr Sureshkumar.

Elle a déclaré : « Notre étude ouvre la voie à des recherches plus approfondies sur le rôle de ces protéines dans divers processus biologiques et maladies humaines. »

« Les résultats représentent non seulement des conséquences potentielles pour la santé humaine, mais contribuent également à notre compréhension de la biologie végétale, qui est déjà avancée. »

Le Dr Sureshkumar, qui a dirigé cette étude internationale incluant des institutions du Royaume-Uni, de Chine, du Canada, d'Inde et d'Australie, a déclaré que la collaboration multinationale les avait aidés à progresser dans divers aspects de cette recherche.
Le Dr Sureshkumar a déclaré que cette recherche pourrait ouvrir la voie au développement de nouvelles techniques thérapeutiques ciblant la dérégulation épigénétique chez les personnes atteintes de maladies génétiques. Plus d'information:Sridevi Sureshkumar et al, la protéase SUMO FUG1, le lecteur d'histone AL3 et la protéine chromodomaine LHP1 font partie intégrante du silençage génique induit par l'expansion de la réplication chez Arabidopsis thaliana. Plantes naturelles

(2024).
est ce que je: 10.1038/s41477-024-01672-5


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